关于非法经营案件中证人笔录的制作次数，并没有一个固定的法律标准或硬性规定，它主要取决于案件的具体情况和侦查机关的需要。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
案件复杂程度：
- 在简单的非法经营案件中，如果事实清楚、证据确凿，侦查机关可能只需要对关键证人进行一两次笔录，以确认案件事实。
- 然而，在复杂的非法经营案件中，涉及多个环节、多个证人或存在争议点时，侦查机关可能会对多个证人进行多次笔录，以全面收集证据、查明事实真相。
侦查阶段的需要：
- 在侦查初期，侦查机关可能主要关注案件的基本事实和关键证据，因此可能只对少数证人进行笔录。
- 随着侦查的深入，如果发现新的线索或需要进一步核实某些事实，侦查机关可能会对更多证人进行笔录，或者对已经做过笔录的证人进行再次询问。
证人配合程度：
- 如果证人积极配合侦查工作，提供详细、准确的证言，那么侦查机关可能不需要对其进行多次笔录。
- 如果证人配合度不高，或者提供的证言存在矛盾、模糊之处，侦查机关可能会对其进行多次笔录，以澄清事实、消除疑点。
法律程序要求：
- 在某些情况下，法律程序可能要求对特定证人进行多次笔录。例如，如果证人的证言对案件定性有重大影响，或者证人本身存在可信度问题，侦查机关可能会对其进行多次询问以确保证言的真实性和可靠性。
法律建议：
- 对于非法经营案件的嫌疑人或被告人来说，如果担心证人笔录的制作次数或内容可能对自己不利，建议及时咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及如何应对可能的法律后果。
- 对于证人来说，如果被要求制作笔录，应当如实陈述自己所知道的事实，不得隐瞒或歪曲真相。同时，也有权要求侦查机关保障自己的合法权益，如要求侦查人员出示相关证件、了解笔录内容等。
可能后果：
- 如果证人笔录的制作次数过多或内容存在矛盾，可能会影响案件的侦查进度和审判结果。因此，侦查机关在制作证人笔录时应当谨慎、客观、公正，确保证言的真实性和可靠性。
- 对于嫌疑人或被告人来说，如果证人笔录对自己不利，且没有其他证据予以反驳或证明自己的清白，可能会面临被定罪处罚的风险。因此，在面临非法经营案件时，应当及时寻求法律帮助，维护自己的合法权益。
总之，非法经营案件中证人笔录的制作次数并没有一个固定的标准，它取决于案件的具体情况和侦查机关的需要。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。