国有企业员工因违章造成损失，经济追偿一般不由人事部门或安全部门直接扣款，而是依据企业内部规章制度和法律规定，通过合法程序进行追偿。以下从不同角度详细分析：

1. 部门职责角度：

   • 人事部门主要负责员工的人事管理，如招聘、培训、考核、薪酬等，一般不直接涉及员工因违章造成的经济损失追偿。
   • 安全部门则负责企业的安全生产管理，包括制定安全规章制度、监督安全执行情况等。虽然安全部门会关注员工的违章行为，但其主要职责并非直接进行经济追偿。

2. 追偿程序角度：

   • 当员工因违章造成企业经济损失时，企业通常会依据内部规章制度（如员工手册、安全生产责任制等）进行调查，并确定责任归属。
   • 追偿程序一般包括：与员工沟通确认损失情况、根据规章制度确定追偿金额、通过合法途径（如工资扣除、法律诉讼等）进行追偿。
   • 在这个过程中，人事部门和安全部门可能会参与调查或提供相关证据，但并非直接执行扣款。

3. 法律规定角度：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》和相关法律法规，企业因员工违章造成经济损失而追偿时，需遵循合法、合理、公平的原则，且追偿金额不得超过员工当月工资的20%（若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付）。
   • 企业不得随意扣款或侵犯员工的合法权益，否则可能面临法律责任。

4. 实际操作建议：

   • 企业应建立健全内部规章制度，明确员工违章造成经济损失的追偿程序和标准。
   • 在追偿过程中，企业应确保程序合法、证据充分，并尊重员工的合法权益。
   • 若员工对追偿有异议，企业应提供合理的解释和证据，或通过法律途径解决争议。

总结来说，国有企业员工因违章造成损失的经济追偿，并非由人事部门或安全部门直接扣款，而是依据企业内部规章制度和法律规定，通过合法程序进行。企业在追偿过程中应确保程序合法、证据充分，并尊重员工的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。