申请强制执行的费用最终由被执行人（即被申请人）承担。以下是对这一问题的详细解答：
一、费用承担原则
根据《诉讼费用交纳办法》的相关规定，申请执行人民法院发生法律效力的判决、裁定、调解书等情形时，执行申请费应由被执行人负担。这一原则体现了法律的公正性和权威性，确保了执行程序的顺利进行。
二、费用交纳流程
- 申请阶段无需预交：申请人在向法院申请强制执行时，无需预先交纳执行申请费。这一规定减轻了申请人的经济负担，使其能够顺利启动执行程序。
- 执行中收取：法院在执行生效法律文书确定的内容之外，会直接对被执行人收取强制执行费用。这一步骤确保了执行费用的及时收缴。
- 和解协议下的协商：如果执行过程中当事人达成和解协议，那么申请费的负担可以由双方当事人协商解决。若协商不成，则由人民法院根据具体情况作出决定。
- 执行完毕后的扣划：在法院执行完毕后，强制执行费用会从被执行人的账户中扣划并缴纳给法院或相关部门。
三、费用交纳标准
执行费用的具体计算依据执行金额或价额进行分段累计交纳，具体标准如下：
- 若没有执行金额或价额，则每件案件需交纳50元至500元的费用；
- 若执行金额或价额不超过1万元，则每件案件交纳50元；
- 超过1万元至50万元的部分，按1.5%的比例交纳；
- 超过50万元至500万元的部分，按1%的比例交纳；
- 超过500万元至1000万元的部分，按0.5%的比例交纳；
- 超过1000万元的部分，则按0.1%的比例交纳。
四、特殊情况处理
- 预缴情况：在极少数情况下，法院可能会要求申请人先预缴执行费，但这种情况较为罕见。若遇此情况，申请人应按法院要求进行操作。
- 和解协议影响：若执行过程中双方达成和解协议，费用的负担方式可能根据和解协议的具体内容进行调整。但通常情况下，和解协议不会改变被执行人承担执行费用的基本原则。
五、法律建议
- 遵守判决：为避免不必要的麻烦和费用，建议当事人最好还是按判决来履行。这样不仅可以避免强制执行程序带来的额外经济负担，还能维护法律的权威性和公信力。
- 注意和解协议：如果执行过程中双方有达成和解协议的意向，应明确费用负担方式，并确保和解协议的内容符合法律法规的要求。
在实际操作中，如果遇到关于申请强制执行费用的具体问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律解答和建议。