举报非法行医时，即使对方通过微信不承认违法，这并不影响举报的合法性和有效性。以下从几个方面为你详细分析：
一、举报非法行医的法律依据
根据《中华人民共和国基本医疗卫生与健康促进法》和《中华人民共和国医师法》等相关法律法规，未取得医生执业资格的人非法行医，是违法行为，应当受到法律的制裁。因此，当你发现有人非法行医时，有权向相关部门进行举报。
二、微信聊天记录作为证据的效力
- 证据形式：微信聊天记录属于电子数据的一种，根据《中华人民共和国民事诉讼法》等相关法律法规，电子数据是可以作为证据使用的。因此，如果你保存了与非法行医者的微信聊天记录，这些记录可以作为举报的证据之一。
- 证据内容：微信聊天记录中如果包含了非法行医者承认自己非法行医、提供医疗服务、收取费用等关键信息，那么这些记录将具有较高的证明力。即使对方在后续否认，这些记录也可以作为反驳的证据。
- 证据保全：为了确保微信聊天记录的完整性和真实性，建议你及时对聊天记录进行截图或录屏保存，并尽可能保留原始载体（如手机、电脑等）。在必要时，可以向公证机构申请对聊天记录进行公证，以增强其证明力。
三、举报流程与注意事项
- 举报流程：你可以向当地的卫生健康行政部门或公安机关进行举报。在举报时，应提供详细的举报信息，包括非法行医者的姓名、地址、联系方式、非法行医的时间、地点、方式等，以及你掌握的证据材料（如微信聊天记录、照片、视频等）。
- 注意事项：
- 保护自身安全：在举报非法行医时，要注意保护自己的安全，避免与非法行医者发生直接冲突。
- 如实举报：举报时应如实提供信息，不得捏造或歪曲事实。否则，你可能需要承担相应的法律责任。
- 配合调查：在相关部门进行调查时，应积极配合并提供必要的协助。
四、对方不承认违法的法律后果
即使对方通过微信不承认违法，这并不影响相关部门对其非法行医行为的调查和处理。如果相关部门经过调查确认对方存在非法行医行为，将依法对其进行处罚，包括罚款、没收违法所得、吊销执业证书等。在严重情况下，还可能构成犯罪，需要承担刑事责任。
建议：如果你发现了非法行医行为，不要因为对方不承认而放弃举报。相反，你应该积极收集证据并向相关部门进行举报，以维护公共健康和安全。如果你在举报过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。