在绿灯还剩3秒时停车被追尾，责任认定需结合具体情形综合判断，但通常后车未保持安全距离是主要原因，需承担主要或全部责任。以下是具体分析：

1. 后车未保持安全距离的责任
   根据《道路交通安全法》第四十三条，同车道行驶的机动车需与前车保持足以采取紧急制动措施的安全距离。若后车因未保持安全距离导致追尾，即使前车在绿灯剩余时间内停车，后车仍需承担主要或全部责任。例如：前车因前方拥堵或行人通过而合理减速停车，后车因跟车过近无法及时制动，此时后车全责。

2. 前车是否存在违规停车的情形
   若前车在绿灯剩余时间内突然急刹停车，且无合理理由（如避让障碍物、行人等），可能被认定为“操作不当”。但实践中，此类情形需结合具体证据判断，例如行车记录仪视频、路口监控等。若前车存在违规停车，责任可能按比例分担（如前车次责、后车主责），但后车未保持安全距离仍是主要过错。

3. 特殊情形：前车恶意刹车或路况异常
   若前车存在恶意急刹（如斗气驾驶）或因突发路况（如前方事故、道路塌陷）被迫停车，需根据证据区分责任。例如：前车因前方事故突然停车，后车因未观察路况追尾，此时后车仍需承担主要责任；但若前车恶意急刹且无证据支持，可能被认定存在过错。

建议处理步骤：

1. 立即报警并保护现场，由交警通过勘查、调取监控等方式认定责任；
   
2. 收集证据（如行车记录仪、证人证言）以支持责任认定；
   
3. 若对责任认定有异议，可在收到《道路交通事故责任认定书》后3日内申请复核。
   

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