结论：借1000逾期一天扣10元是否合法，需结合具体情形判断，若该费用属于逾期利息或违约金，且综合计算后的年利率未超过合同成立时一年期贷款市场报价利率四倍，则合法；若超过，则不合法；若该费用属于其他不合理名目或存在其他违法情形，亦不合法。以下为详细分析：
一、若该费用属于逾期利息或违约金
法律规定：
- 根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》第二十五条：“出借人请求借款人按照合同约定利率支付利息的，人民法院应予支持，但是双方约定的利率超过合同成立时一年期贷款市场报价利率四倍的除外”。
- 同时，该规定第二十九条也明确了：“出借人与借款人既约定了逾期利率，又约定了违约金或者其他费用，出借人可以选择主张逾期利息、违约金或者其他费用，也可以一并主张，但是总计超过合同成立时一年期贷款市场报价利率四倍的部分，人民法院不予支持”。
计算与分析：
- 假设当前一年期贷款市场报价利率为3.85%（此数值会随时间变动，需以实际为准），则其四倍为15.4%。
- 若借款1000元，逾期一天扣10元作为利息或违约金，则年化利率计算为：\((10元 \div 1000元) \times 365天 = 36.5\%\)。
- 显然，36.5%远超过了15.4%的法定上限，因此，在这种情况下，逾期一天扣10元是不合法的。
二、若该费用不属于逾期利息或违约金，而是其他名目的费用
法律规定：
- 除了逾期利息和违约金外，如果出借人还以其他名目（如手续费、管理费等）收取费用，这些费用同样受到法律对利率上限的限制。即，所有费用加起来，年化利率也不能超过合同成立时一年期贷款市场报价利率的四倍。
分析：
- 如果这10元并非作为逾期利息或违约金，而是以其他不合理名目收取，且加上其他所有费用后，年化利率超过了法定上限，那么这种收费同样是不合法的。
- 另外，如果出借人存在欺诈、胁迫等违法行为，或者借款合同本身存在无效情形（如违反法律、行政法规的强制性规定等），那么任何形式的收费都可能是不合法的。
三、建议与提醒
核实费用性质：
- 借款人应首先核实这10元费用的具体性质，是逾期利息、违约金还是其他名目的费用。
计算年化利率：
- 根据费用性质和借款金额、期限，计算年化利率，以判断是否超过法定上限。
保留证据：
- 借款人应保留好借款合同、还款记录、收费凭证等相关证据，以备不时之需。
寻求法律帮助：
- 如果借款人认为出借人的收费行为不合法，或者双方就费用问题存在争议，可以寻求专业律师的法律帮助，通过法律途径维护自己的合法权益。
最后，借款人在签订借款合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于利息、违约金等费用的约定，确保自己能够理解和接受。如果有任何疑问或不确定的地方，应及时向出借人或专业律师咨询。