公司违法处理废电瓶180个被环保部门查处后，应立即停止违法行为，积极配合调查，并依法承担相应的法律责任，包括接受行政处罚、采取补救措施，若构成犯罪还需承担刑事责任。 以下是具体分析：

一、立即停止违法行为并配合调查

1. 停止违法行为：公司应立即停止所有违法处理废电瓶的行为，防止环境损害进一步扩大。
2. 配合调查：积极配合环保部门的调查工作，提供必要的资料和信息，如实陈述事实情况。

二、依法承担行政责任

1. 接受行政处罚：根据《中华人民共和国固体废物污染环境防治法》等相关法律法规，公司可能面临罚款、没收违法所得、责令停产整治等行政处罚。具体处罚措施将由环保部门根据违法行为的性质、情节及造成的后果等因素综合确定。
2. 整改措施：公司需按照环保部门的要求，制定并实施整改方案，确保废电瓶得到合法、安全的处理，防止类似违法行为再次发生。

三、采取补救措施

1. 环境修复：如果违法行为已经对环境造成了损害，公司应承担环境修复的责任，采取有效措施恢复环境原状或减轻环境损害。
2. 赔偿损失：若违法行为给第三方造成了损失，公司还需依法承担赔偿责任。

四、可能面临的刑事责任

1. 构成犯罪的情形：如果公司的违法行为情节严重，构成污染环境罪等刑事犯罪，将依法追究刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，污染环境罪可处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金；后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。
2. 刑事责任与行政责任的区分：刑事责任与行政责任是独立的两种法律责任，公司即使承担了行政责任，如果构成犯罪，仍需承担刑事责任。

五、建议与措施

1. 加强内部管理：公司应建立健全内部管理制度，加强对废电瓶等危险废物的管理，确保合法、安全处理。
2. 培训与教育：定期对员工进行环保法律法规的培训和教育，提高员工的环保意识和法律意识。
3. 寻求专业帮助：在处理此类违法行为时，建议公司寻求专业律师或环保咨询机构的帮助，确保合法合规地应对环保部门的查处。

公司应认真对待环保部门的查处，积极采取措施纠正违法行为，并依法承担相应的法律责任。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。