三方协议中的违约金条款通常由协议各方协商确定后，共同写入协议的补充条款、附加约定部分或正文相关条款中，并无固定由哪一方单独书写的规定。以下从不同角度详细分析：
一、违约金条款的书写位置
补充条款或附加约定：
- 三方协议在签订时，除了固定的格式条款外，往往还会留有空白处供各方协商填写补充条款或附加约定。
- 违约金的具体数额、支付方式及条件等，通常会在这些补充条款或附加约定中明确。这种方式灵活性强，便于各方根据实际情况进行协商和调整。
正文相关条款：
- 有些三方协议的正文中也会包含关于违约责任的条款，其中可能涉及违约金的支付问题。
- 在这种情况下，违约金条款会直接写入协议的正文部分，与协议的其他条款具有同等的法律效力。这种方式使得违约金条款更加正式和明确，便于各方遵守和执行。
二、违约金条款的内容要点
无论违约金条款书写在协议的哪个位置，都应明确以下内容：
违约情形：
- 明确哪些行为构成违约，如毕业生未按约定时间报到、用人单位未按约定提供工作岗位等。这有助于各方在协议履行过程中明确各自的责任和义务。
违约金数额：
- 约定具体的违约金数额或计算方式。例如，可以约定为一定金额的固定数额，或者按照某种比例（如培训费用的一定比例）来计算。违约金数额的约定应合理，不得过高或过低，以免被认定为显失公平而无效。
支付方式：
- 明确违约金的支付方式，如一次性支付还是分期支付等。这有助于确保违约金的及时支付和协议的顺利履行。
其他约定：
- 根据具体情况，还可以约定其他与违约金相关的内容，如违约金的减免条件、争议解决方式等。这些约定可以进一步细化违约金条款，提高其可操作性和实用性。
三、注意事项
合法性审查：
- 违约金条款的约定必须符合国家法律法规的规定，不得违反法律强制性规定。例如，约定的违约金数额不得过高，以免被认定为显失公平而无效。同时，根据《劳动合同法》的相关规定，除特定情形外，用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。
协商一致原则：
- 违约金条款的约定应遵循协商一致的原则，确保各方对条款内容有充分的理解和认可。在协商过程中，各方应充分表达自己的意见和诉求，寻求共识和妥协，以达成公平合理的违约金条款。
书面形式：
- 违约金条款应以书面形式明确约定在三方协议中，以确保其具有法律效力。书面形式可以固定各方的意思表示，避免口头约定可能带来的争议和不确定性。
四、示例模板
以下是一个三方协议中违约金条款的示例模板，供参考：
#### 第七条 违约责任
1. **毕业生违约责任**：
- 若乙方（毕业生）在签约后至入职前单方面解除本协议且无正当理由，应向甲方（用人单位）支付违约金人民币______元（大写：____________）。
- *注：违约金不超过甲方为乙方支付的培训费、招聘费等实际支出（附凭证）。*
2. **用人单位违约责任**：
- 若甲方未按协议约定提供岗位或工资待遇，乙方有权解除协议，甲方需退还乙方已支付的费用并按同等标准支付违约金。
3. **免责情形**：
- 因自然灾害、政策变动等不可抗力导致协议无法履行的，双方互不承担责任。
4. **争议处理**：
- 协商不成时，任何一方可向甲方所在地人民法院提起诉讼。
在实际操作中，各方应根据具体情况和需求，对违约金条款进行细化和完善，以确保其合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。