三方协议违约金的规定主要依据《民法典》的相关条款，特别是其中关于合同违约责任的部分。具体来说，根据《民法典》的规定，当事人在合同中可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。

在三方协议中，如果双方明确约定了违约金条款，那么当一方违约时，违约方通常需要按照约定向守约方支付违约金。然而，如果约定的违约金过分高于造成的损失，违约方有权请求法院或仲裁机构适当减少。同样，如果约定的违约金低于造成的损失，守约方也可以请求法院或仲裁机构予以增加。

值得注意的是，三方协议中的违约金数额并没有统一固定的上限标准，通常由合同当事人自行约定。但根据《民法典》的公平原则和诚实信用原则，违约金的数额应当合理，不应过高或过低。在实践中，法院或仲裁机构会根据具体案件情况，综合考量实际损失、合同履行情况、当事人过错程度以及预期利益等多种因素，对违约金数额进行判定或调整。

此外，需要强调的是，三方协议是毕业生与用人单位之间的一种预约合同，并非劳动合同。因此，在三方协议中约定的违约金条款应受到《民法典》合同编等相关法律法规的调整，而不适用《劳动法》以及《劳动合同法》等规定。

总的来说，三方协议违约金的规定主要依据《民法典》中关于合同违约责任的相关条款，并且违约金的数额和支付方式应由合同当事人自行约定，但需符合公平原则和诚实信用原则。