核心结论：当甲方启动见索即付履约保函后，乙方若认为甲方索赔不合理或存在争议，可通过以下途径追要自身权益或应对索赔，具体需结合保函条款、合同约定及实际情况选择合适方式。

1. 核查保函条款与索赔文件

• 保函独立性原则：见索即付保函具有独立性，银行或担保机构仅需审核索赔文件是否符合保函表面形式要求（如单据齐全、签字盖章等），无需审查基础合同纠纷。因此，乙方需首先确认甲方索赔是否严格符合保函条款（如索赔通知格式、期限、金额等）。
• 文件瑕疵抗辩：若甲方索赔文件存在形式瑕疵（如未在保函有效期内提交、缺少必要单据等），乙方应立即向担保机构提出书面异议，要求拒付或暂缓支付，并保留相关证据（如邮寄凭证、沟通记录）。

2. 主张基础合同抗辩

• 合同履行情况：若乙方已按合同约定履行义务，或甲方索赔金额与实际损失不符，乙方可依据基础合同向甲方提出反索赔，要求撤销或调整索赔金额。例如：
  • 甲方未提供充分证据证明乙方违约；
  • 索赔金额超过合同约定的违约金上限；
  • 乙方已通过其他方式弥补甲方损失（如维修、返工）。
• 欺诈或滥用权利抗辩：若甲方恶意索赔（如虚构违约事实、与担保机构串通），乙方可依据《最高人民法院关于审理独立保函纠纷案件若干问题的规定》向法院申请止付令，或提起侵权诉讼主张赔偿。

3. 通过法律程序追要权益

• 诉讼或仲裁：若双方对保函索赔存在争议，乙方可依据基础合同中的争议解决条款（如仲裁协议或诉讼管辖约定），向法院起诉或申请仲裁，要求确认乙方无违约责任或调整索赔金额。
• 申请止付令：在紧急情况下，乙方可向法院申请临时止付令，阻止担保机构付款。需满足以下条件：
  • 保函项下的付款条件尚未成就；
  • 甲方存在明显欺诈或滥用权利行为；
  • 乙方已提供充分担保（如保证金、反担保）。

4. 与担保机构沟通协商

• 提出异议：乙方可向担保机构提交书面异议，说明甲方索赔不符合保函条款或基础合同约定，要求担保机构暂缓支付并启动调查程序。
• 参与调查：若担保机构启动调查，乙方应积极配合提供证据（如合同、履约记录、沟通记录等），以证明自身无违约或索赔不合理。

5. 预防性措施（未来合同中）

• 优化保函条款：在签订合同时，乙方可要求约定保函的“有效期与合同履行期匹配”“索赔需附第三方鉴定报告”等条款，降低被恶意索赔风险。
• 要求反担保：要求甲方提供反担保（如保证金、抵押物），在保函被兑付后可通过反担保追偿损失。

行动建议：

1. 立即收集并整理所有与保函、基础合同相关的文件（如保函副本、合同、履约证据、索赔通知）；
   
2. 评估甲方索赔的合理性及保函条款的合规性；
   
3. 根据争议大小选择协商、止付令或诉讼/仲裁；
   
4. 如有需要，可委托律师协助起草异议函、止付申请或诉讼材料。
   

如有进一步细节（如保函具体条款、合同履行情况），可向我补充说明，以便提供更精准的建议。