关于单位扣除全部绩效工资后离职是否有补偿的问题，结论前置如下：
- 若单位扣除绩效工资的行为合法，离职时一般无额外补偿（但经济补偿金计算可能包含绩效工资）。
- 若单位扣除绩效工资的行为违法，离职时除应补发工资外，还可能涉及经济补偿或赔偿金。
一、合法扣除绩效工资的情形及离职补偿规则
根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关司法解释，若单位扣除绩效工资的行为符合以下条件，则属于合法操作，离职时一般无额外补偿，但经济补偿金计算需包含绩效工资：
依据合法有效的规章制度
单位需有明确、合理且经民主程序制定（如职工代表大会讨论、公示）的规章制度，其中需详细规定绩效工资的核算方式、发放条件及离职处理办法。例如：
- 制度规定“月度绩效奖金根据当月工作任务完成情况考核发放”，员工因工作失误导致绩效不合格，单位按制度扣除绩效工资的，属于合法行为。
- 离职补偿金计算：此时经济补偿金仍需包含绩效工资，因《劳动合同法》第四十七条明确规定，经济补偿按离职前12个月平均工资计算，而平均工资包含奖金、津贴等货币性收入（参考《劳动合同法实施条例》第二十七条）。
劳动合同有明确约定
若劳动合同中明确约定“离职时绩效工资按实际出勤天数及完成比例核算发放”，且该约定不违反法律法规，单位按合同扣除绩效工资的，亦属合法。
- 离职补偿金计算：同样需将绩效工资纳入经济补偿金计算范围，除非合同另有排除性约定（但此类约定需经双方协商一致，且不得违反法律强制性规定）。
二、违法扣除绩效工资的情形及离职补偿规则
若单位扣除绩效工资的行为符合以下情形，则属于违法操作，离职时员工有权要求单位补发工资，并可能涉及经济补偿或赔偿金：
缺乏制度或合同依据
单位既无相关规章制度，劳动合同中也未约定离职时绩效工资扣除规则，却以“离职影响团队绩效”等理由随意扣除的，属于克扣工资行为。
- 法律后果：员工可要求单位补发工资，并依据《劳动合同法》第三十八条、第四十六条主张经济补偿金（按工作年限计算，每满一年支付一个月工资）。
考核不公正不合理
单位虽制度或合同有约定，但考核标准不公正（如离职时突然大幅降低绩效评分且无合理解释），或未按实际绩效核算（如未按完成比例计算却直接扣除全部绩效工资）的，亦属违法。
- 法律后果：员工可要求单位重新核算绩效工资并补发差额，同时主张经济补偿金。若单位行为构成恶意克扣，员工还可依据《劳动合同法》第八十五条要求加付赔偿金（需先经劳动行政部门责令限期支付）。
三、员工权益保护建议
- 协商沟通：若发现单位违法扣除绩效工资，可先与单位协商，要求出具扣除依据及核算明细。
- 投诉或仲裁：协商无果的，可向当地劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁（需在离职后1年内提出）。
- 仲裁请求：可主张补发工资、支付经济补偿金（或赔偿金），并提交劳动合同、工资条、考核记录等证据。
- 法律程序：若对仲裁结果不服，可在收到裁决书后15日内向法院起诉。
四、示例说明
案例1：小王与公司劳动合同约定“离职时绩效工资按实际完成比例发放”，小王离职时完成比例为80%，但公司直接扣除全部绩效工资。
- 分析：公司行为违法，小王可要求补发80%的绩效工资，并主张经济补偿金（若公司拒绝补发）。
- 计算：若小王月工资（含绩效）为1万元，工作3年，经济补偿金为3万元（1万×3）。
案例2：小李公司制度规定“绩效不合格者扣除当月全部绩效工资”，小李因工作失误被扣绩效，但公司未提供考核记录。
- 分析：公司行为可能违法（考核不公正），小李可要求公司出具考核依据，否则可主张补发工资及经济补偿金。
如有进一步疑问或需具体计算补偿金额，可直接向我咨询。