乡政府多付工程款属于不当得利，应当依法返还，且该返还请求权受诉讼时效限制。具体分析如下：

1. 法律性质与返还义务
   根据《民法典》第122条，乡政府多付工程款构成“不当得利”，承包方（收款方）负有返还义务。若承包方拒绝返还，乡政府可通过民事诉讼主张权利。

2. 诉讼时效期间

   • 时效起算点：自乡政府知道或应当知道多付工程款之日起计算（如审计发现、对账确认等时间点）。
     
   • 时效长度：一般为3年（《民法典》第188条），但若乡政府能证明承包方恶意占有（如明知多付仍拒不返还），可主张适用最长20年保护期（自多付事实发生之日起算）。
     
   • 中断与延长：若乡政府在时效期内通过发函、协商等方式主张权利，或承包方承诺返还，时效可中断并重新计算；若存在不可抗力等法定事由，时效可中止。

3. 实务建议

   • 乡政府角度：
     
     1. 立即固定证据（如付款凭证、合同、对账单等），明确多付金额及时间；
        
     2. 优先通过协商、发律师函等方式要求返还，同时注意保留书面沟通记录；
        
     3. 若协商无果，应在时效期内起诉，避免丧失胜诉权。
        
   • 承包方角度：
     
     1. 核实多付事实，若属实应主动返还，避免被起诉及承担诉讼费用；
        
     2. 若对金额有争议，可要求乡政府提供详细计算依据，或通过第三方审计确认；
        
     3. 若乡政府主张已过时效，可提出抗辩，但需承担举证责任。

提示：若涉及政府财政资金，乡政府还需遵守《财政违法行为处罚处分条例》等行政规定，可能面临内部追责，但不影响其通过民事途径追偿。如有具体细节需进一步分析，可直接向我咨询。