医疗机构若配备有成人防护用品但未配备儿童防护用品，可能面临责令改正、警告、罚款等行政处罚，具体处罚措施需结合实际情况及地方性法规综合判断。以下从不同角度展开分析：

1. 从《传染病防治法》的角度
   根据《中华人民共和国传染病防治法》第六十九条，医疗机构若存在“未按照规定配备防护用品”等情形，卫生行政部门有权责令其改正、通报批评，并可给予警告；若因此造成传染病传播、流行或其他严重后果的，对负有责任的主管人员和其他直接责任人员，依法给予降级、撤职、开除的处分，并可以依法吊销有关责任人员的执业证书；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
   需注意，该条款未明确区分成人与儿童防护用品，但“未按规定配备”可理解为未全面配备符合要求的防护用品（包括儿童专用）。若地方性法规或部门规章对儿童防护用品有明确要求（如儿科门诊必须配备儿童口罩、防护服等），则医疗机构未配备可能直接构成“未按规定配备”，面临上述处罚。

2. 从地方性法规或部门规章的角度
   部分省份或部门可能出台更具体的规定，例如：

   • 某省《医疗机构传染病防控管理办法》可能要求“儿科、急诊等科室必须配备儿童专用防护用品”；
     
   • 国家卫健委发布的《医疗机构新冠肺炎疫情防控技术指南》可能明确“发热门诊应设置儿童专用防护用品储备区”。
     若医疗机构违反此类具体规定，地方卫生行政部门可依据《行政处罚法》及地方性法规，直接作出罚款决定（通常为警告或一定数额罚款，具体金额需参考地方标准）。

3. 从实际执法角度
   实践中，处罚力度通常与以下因素相关：

   • 未配备的严重性：若儿童防护用品缺失导致交叉感染风险显著增加（如儿科门诊未配备儿童口罩），处罚可能更重；
     
   • 整改情况：若医疗机构在责令改正后及时补备，可能仅受警告；若拒不改正，可能面临罚款或停业整顿；
     
   • 后果影响：若因未配备儿童防护用品导致疫情扩散或患儿感染，可能追究刑事责任（如《刑法》第三百三十条“妨害传染病防治罪”）。

建议：医疗机构应主动核查地方性法规及部门规章，确保儿童防护用品配备到位；若已因未配备被处罚，可结合自身整改情况、未配备的客观原因（如供应短缺）等，向卫生行政部门申请从轻或减轻处罚。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的法律风险。