关于协议变更，选择写补充协议还是最后补确定函，这主要取决于变更的内容、性质以及双方的具体需求，但通常更推荐使用补充协议。以下是对这两种方式的详细分析：
补充协议：
- 定义与性质：补充协议是对原协议内容的补充或修改，它通常与原协议具有同等的法律效力。当原协议中的某些条款需要变更、增加或删除时，双方可以通过签订补充协议来明确这些变更。
- 适用场景：适用于对原协议有实质性变更或需要详细规定变更内容的情况。例如，合同金额的变更、履行期限的延长、违约责任的调整等。
- 优势：补充协议能够清晰地记录变更内容，避免未来可能出现的争议。同时，由于它与原协议具有同等的法律效力，因此能够为双方提供更强的法律保障。
确定函：
- 定义与性质：确定函通常是一种单方面的声明或确认，用于确认某些事实或状态。在协议变更的语境下，它可能用于确认双方已就某些变更达成一致，但通常不包含详细的变更条款。
- 适用场景：适用于变更内容相对简单、明确，且双方对变更无争议的情况。例如，仅确认合同中的某个具体数字或日期等。
- 局限性：确定函可能无法像补充协议那样详细规定变更内容，因此在未来可能引发争议时，其证明力可能相对较弱。
法律建议：
- 优先选择补充协议：如果协议变更涉及实质性内容或需要详细规定变更条款，建议双方签订补充协议。这样能够确保变更内容的清晰性和可执行性，同时降低未来可能出现的法律风险。
- 明确变更内容：无论选择哪种方式，都应确保变更内容明确、具体，并避免使用模糊或歧义的表述。这有助于减少未来可能出现的争议和误解。
- 保留书面证据：无论签订补充协议还是确定函，都应保留书面证据以备不时之需。这有助于在争议发生时提供有力的法律支持。
可能后果：
- 如果未选择适当方式记录变更：可能导致双方对变更内容存在争议，进而影响协议的履行和双方的合作关系。在极端情况下，甚至可能引发法律纠纷和诉讼。
- 如果变更内容未明确或存在歧义：可能导致双方对变更的理解不一致，进而影响协议的履行效果。这同样可能引发争议和纠纷。
综上所述，在协议变更时，通常更推荐使用补充协议来明确变更内容。当然，具体选择哪种方式还需根据变更的内容、性质以及双方的具体需求来决定。如果你有任何关于协议变更的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。