结论：当事人之间存在其他基础法律关系，但出具了借条的，是否按民间借贷处理，不能一概而论，需根据具体情况判断。以下从不同角度进行分析：

1. 若借条能真实反映借贷关系

• 情况说明：即便当事人之间原本存在其他基础法律关系（如买卖合同、投资关系等），但如果双方后续通过协商，将之前的债权债务关系转化为借贷关系，并出具了借条，且该借条是双方真实意思表示，不违反法律法规的强制性规定，那么应当按照民间借贷关系来处理。
• 法律依据：根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》的相关精神，民间借贷关系的成立，关键在于双方是否有借贷的合意，以及款项是否实际交付。若借条能证明这些要素，即可认定为民间借贷。
• 举例：甲和乙原本存在买卖合同关系，甲欠乙货款。后双方协商，将货款转化为借款，并由甲向乙出具借条。此后，甲未按借条约定还款，乙起诉至法院，法院会按照民间借贷关系来审理此案。

2. 若借条不能真实反映借贷关系，而是其他法律关系的变通或掩盖

• 情况说明：如果当事人之间出具借条，并非出于真实的借贷意图，而是为了变通或掩盖其他法律关系（如逃避税收、规避法律限制等），那么该借条可能不会被法院认定为民间借贷关系的有效证据。此时，法院会穿透借条的表面形式，探究双方的真实意思表示和实际法律关系。
• 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民事法律行为应当遵循诚实信用原则，不得违反法律、行政法规的强制性规定，不得违背公序良俗。若借条的出具违反了这些原则，法院可能不会支持按照民间借贷关系处理。
• 举例：甲和乙为了逃避税收，将原本的买卖合同关系伪装成借贷关系，并出具了借条。但实际上，双方并没有真实的借贷行为发生。若甲或乙以此借条起诉至法院要求还款，法院在查明事实后，可能不会按照民间借贷关系来审理此案。

3. 特殊情况下的处理

• 情况说明：在某些特殊情况下，即使当事人之间出具了借条，也可能因为涉及其他复杂法律关系（如刑事犯罪、虚假诉讼等）而无法简单按照民间借贷关系处理。此时，需要法院根据具体情况进行综合判断。
• 举例：甲和乙之间存在经济纠纷，甲为了迫使乙还款，伪造了借条并起诉至法院。若法院在审理过程中发现该借条系伪造，且甲的行为涉嫌虚假诉讼罪，那么法院不仅不会按照民间借贷关系来审理此案，还可能将案件移送公安机关处理。

建议：在处理涉及借条的案件时，当事人应当充分了解借条的法律性质和后果，确保借条的出具是出于真实、合法的借贷意图。若存在其他基础法律关系或特殊情况，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见和帮助。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问。