企业不能完全自行决定劳动合同中的工作时间和休息休假安排，但可以在法律允许的范围内进行一定的自主设定。以下是对这一问题的详细分析：

法律规定

1. 工作时间：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。这是法定的标准工作时间，企业应当遵守。
   • 同时，该法第三十九条也规定了企业因生产特点不能实行标准工时制度的，经劳动行政部门批准，可以实行其他工作和休息办法，如不定时工作制、综合计算工时工作制等。但这并不意味着企业可以随意设定工作时间，仍需经过审批并符合相关条件。

2. 休息休假：

   • 《中华人民共和国劳动法》第三十八条规定，用人单位应当保证劳动者每周至少休息一日。这是法定的休息日，企业必须遵守。
   • 此外，该法还规定了法定节假日、年休假、探亲假、婚丧假、产假等休假制度，企业也应当按照法律规定执行。

企业自主设定范围

1. 在法律允许的范围内：

   • 企业可以在不违反法律强制性规定的前提下，根据自身的生产经营需要，与劳动者协商确定具体的工作时间和休息休假安排。例如，企业可以与劳动者约定实行弹性工作制、轮班制等，但必须确保劳动者的总工作时间不超过法定标准，并保障劳动者的休息权。

2. 需考虑劳动者权益：

   • 企业在设定工作时间和休息休假时，必须充分考虑劳动者的身心健康和合法权益。不得通过不合理的工作时间安排来损害劳动者的利益，如强制加班、不安排休息日等。

法律后果

1. 违法设定工作时间和休息休假的后果：

   • 如果企业违反法律规定，擅自设定不合理的工作时间和休息休假安排，将可能面临劳动行政部门的处罚，如警告、罚款等。
   • 同时，劳动者也有权向劳动争议仲裁委员会或人民法院提起诉讼，要求企业纠正违法行为并赔偿损失。

2. 劳动者权益保护：

   • 劳动者在面对企业违法设定工作时间和休息休假时，应当积极维护自己的合法权益。可以向劳动行政部门投诉、申请劳动争议仲裁或提起诉讼等。

实际操作建议

1. 企业应遵守法律规定：

   • 企业在设定工作时间和休息休假时，应当严格遵守法律规定，确保劳动者的合法权益得到保障。

2. 与劳动者协商：

   • 企业可以与劳动者进行充分协商，根据生产经营需要和劳动者的实际情况，共同确定合理的工作时间和休息休假安排。

3. 建立完善的制度：

   • 企业应当建立完善的工作时间和休息休假制度，明确各项规定和操作流程，确保制度的合法性和可操作性。

总结来说，虽然企业在一定程度上可以自主设定劳动合同中的工作时间和休息休假安排，但必须严格遵守法律规定，并充分考虑劳动者的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。