不是夫妻关系的两人，在遵守相关法律法规和道德规范的前提下，是可以入住同一间旅店客房的。以下从不同角度为您详细分析：
法律层面
自主选择住宿方式的权利：
- 我国法律并未明确禁止非夫妻关系的成年人共同入住同一间房。公民有自主选择住宿方式的权利，只要双方均为完全民事行为能力人，且自愿开房，不违反法律法规，旅店通常无权拒绝接待。
身份登记要求：
- 根据《旅馆业治安管理办法》的相关规定，旅店接待旅客住宿必须登记，查验旅客的身份证件。无论是夫妻还是非夫妻，入住旅店时均需出示有效身份证件进行登记，这是遵守治安管理的基本要求。
特定情况下的法律责任：
- 有配偶者与他人同居：若双方或其中一方已婚，并在旅店内发生性关系，可能违反《民法典》中关于禁止有配偶者与他人同居的规定。虽然这不一定构成重婚罪，但可能对婚姻造成伤害，引发家庭矛盾和社会道德争议。
- 与未成年人同居：成年人与未满十四周岁的未成年人同居并发生关系，无论未成年人是否自愿，均构成强奸罪，将受到法律的严厉制裁。
- 卖淫嫖娼：非夫妻关系的男女在旅店内进行金钱交易，即卖淫嫖娼，属于违法行为，将依据《中华人民共和国治安管理处罚法》受到相应的治安处罚。
社会文化和道德层面
- 尽管法律上未明确禁止非夫妻男女共同入住旅店，但由于社会文化差异和旅店管理政策的不同，具体执行过程中仍需注意细节。
- 在一些文化较为保守的地区，非夫妻男女开房可能会引起不必要的关注或误解。因此，在选择住宿时，应尊重当地的文化风俗，考虑选择私密性较好的住宿环境，避免过度张扬。
实际操作建议
- 携带有效身份证件：入住旅店时，双方应携带有效身份证件，以便旅店进行登记。
- 遵守旅店规定：入住后，应遵守旅店的规章制度，不得从事违法犯罪活动。
- 尊重社会道德：即使在法律允许的范围内，也应自觉遵守社会道德，维护良好的社会风气。
总结来说，不是夫妻关系的两人共同入住一间旅店客房并不违法，但前提是必须遵守相关法律法规和道德规范，确保自己的行为合法合规。如果您在入住旅店过程中遇到任何法律问题或纠纷，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。