为员工虚开个税5千元一年属于违法行为，将面临严重的法律后果，包括但不限于税务处罚、刑事责任等，企业应立即停止此类行为并主动纠正。以下是对此问题的详细分析：
一、法律背景
- 税收征管法：根据《中华人民共和国税收征收管理法》的相关规定，纳税人必须如实申报纳税，不得虚报、瞒报。虚开个税属于违法行为，税务机关有权进行处罚。
- 刑法：如果虚开个税的行为构成犯罪，如逃税罪等，将依法追究刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，逃税数额较大且占应纳税额一定比例以上的，将面临有期徒刑、拘役或罚金等刑罚。
二、法律后果
税务处罚：
- 税务机关将对企业进行税务稽查，一旦发现虚开个税的行为，将依法进行处罚，包括补缴税款、滞纳金和罚款等。
- 罚款的数额通常根据虚开税款的金额和情节严重程度来确定，可能远高于虚开的税款本身。
刑事责任：
- 如果虚开个税的行为构成逃税罪，企业及其相关责任人员将面临刑事指控。
- 刑事责任不仅涉及个人声誉和自由，还可能对企业造成重大经济损失和信誉损害。
其他后果：
- 虚开个税还可能影响企业的信用评级和融资能力。
- 在某些情况下，企业可能因虚开个税而被列入税务黑名单，导致后续经营受限。
三、法律建议
- 立即停止虚开行为：企业应立即停止为员工虚开个税的行为，并主动向税务机关申报并纠正之前的错误。
- 配合税务机关调查：在税务机关进行稽查时，企业应积极配合，提供必要的资料和证据，以减轻可能的处罚。
- 加强内部管理：企业应建立健全的财务管理制度，确保纳税申报的准确性和合法性。同时，加强对员工的税务培训，提高员工的税务意识和合规意识。
- 寻求专业法律帮助：如果企业对税务问题存在疑问或需要进一步的法律指导，应及时咨询专业律师或税务师，以确保企业的合法合规经营。
四、特殊情况说明
- 如果企业是在不知情的情况下被员工或第三方利用进行虚开个税，企业应尽快收集证据证明自己的清白，并积极配合税务机关的调查。在这种情况下，企业可能能够减轻或免除部分法律责任。
总之，虚开个税是严重的违法行为，企业应坚决杜绝此类行为的发生。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见。