农村建二楼后面能否留小窗户，主要取决于是否符合法律法规、乡村规划、相邻关系以及安全等因素，若符合相关规定且不侵犯邻居权益，则是合法的；反之则可能不合法。 以下从多个角度进行详细分析：
法律法规层面
- 相邻关系：根据《中华人民共和国民法典》第二百八十八条，不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。若留小窗户不会侵犯邻居的隐私权或其他合法权益，且符合当地乡村规划要求，那么留小窗户是合法的。
- 乡村规划：依据《中华人民共和国城乡规划法》第四十一条，在乡、村庄规划区内进行农村村民住宅建设，需符合当地规划要求。若当地乡村规划对房屋外观、布局等有具体要求，且留小窗户不符合这些要求，则可能不合法。
相邻关系与隐私保护
- 若留的小窗户直接对着邻居的私密空间，如卧室、浴室等，可能侵犯邻居的隐私权，引发邻里纠纷。在这种情况下，即使法律法规没有明确禁止，从维护邻里和谐的角度出发，也不建议留这样的小窗户。
- 建议：在建房时，应充分考虑邻居的隐私需求，通过合理布局避免窗户直对邻居院落或房屋内部。若确实需要留后窗，可以采取一些措施，如安装磨砂玻璃、窗帘等，以减少对邻居隐私的影响。
安全隐患问题
- 后窗可能成为不法分子入侵的通道，增加盗窃等安全风险。同时，小孩也可能通过窗户攀爬导致意外。
- 预防措施：若确需留后窗，应加强安全防护措施，如安装防盗网、监控设备等，以确保家庭安全。
乡村规划与建筑风格
- 部分农村地区有统一的乡村建设规划，对房屋的外观、布局等有具体要求。不留后窗可能是为了保持村庄整体风格协调一致。
- 建议：在建房前，应咨询当地政府或相关部门，了解并遵守当地的乡村规划要求。若规划要求不留后窗，则应遵循这一要求。
实际操作与沟通
- 在实际操作中，若后面户不同意留小窗户，建议先与邻居进行友好沟通，了解他们的顾虑和诉求，并尝试通过协商找到双方都能接受的解决方案。
- 若沟通无果，且认为留小窗户是合法且合理的，可以寻求当地村委会或相关部门的帮助，进行调解或裁决。
总结与建议：农村建二楼后面能否留小窗户，需综合考虑法律法规、乡村规划、相邻关系以及安全等多方面因素。在实际操作中，建议业主在建房前充分了解当地的相关规定和要求，并与邻居进行友好沟通，以寻求双方都能接受的解决方案。若遇到法律问题或纠纷，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议。