面对工厂打工中介乱扣工资的问题，你确实需要采取一系列积极且理性的措施来维护自己的合法权益。以下是我为你整理的详细处理步骤和建议：

一、确认合同与工资条款

首先，你需要仔细查阅与中介签订的合同，特别是关于工资支付、扣款及违约金等关键条款。确保你清楚了解自己的权益和中介的责任。如果合同中有明确的工资支付时间和方式，但中介未按约定执行，那么你有权要求中介给出合理解释并纠正其错误行为。

二、与中介友好沟通

在采取任何法律行动之前，我建议你先尝试与中介进行直接、友好的沟通。了解他们扣款的具体原因，并要求他们提供相应的依据或证据。在沟通过程中，请保持冷静和理智，清晰地表达自己的诉求，并务必保留好聊天记录、通话录音等证据，以备后续需要。

三、向相关部门投诉

如果与中介的沟通没有结果，或者中介的行为明显构成劳动用工范畴内的克扣工资，你可以向当地劳动监察部门投诉。在投诉时，你需要提交身份证明、合同、工资条等材料，以证明你的劳动关系及工资发放情况。劳动监察部门有权进行调查处理，并可以责令中介限期支付克扣的工资，甚至对其处以罚款等行政处罚。

另外，如果中介存在违规经营、欺诈等行为导致扣工资，你还可以向市场监管部门投诉。在投诉时，请详细说明中介的违规事实和扣工资情况，以便市场监管部门能够准确了解问题并采取相应措施。

四、申请劳动仲裁（如适用）

如果纠纷属于劳动争议范畴，并且你与中介协商不成，那么你可以向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁。在申请仲裁时，你需要准备仲裁申请书，写明双方的基本信息、仲裁请求、事实和理由等，并收集相关证据材料。请注意仲裁时效，一般为一年，从你知道或应当知道权利被侵害之日起计算。劳动争议仲裁委员会将审理并作出裁决，如果中介不履行裁决，你可以向人民法院申请强制执行。

五、提起诉讼（如适用）

如果你对劳动仲裁结果不满意，或者纠纷不属于劳动争议范畴，那么你可以向有管辖权的人民法院提起诉讼。在提起诉讼时，你需要撰写起诉状，明确诉讼请求和事实理由，并提交相关证据材料。法院将进行立案审查、开庭审理，并根据审理情况作出判决。如果中介不履行判决，你可以在规定时间内向法院申请强制执行。

六、寻求法律援助或咨询专业律师

在整个处理过程中，如果你需要专业的法律帮助，我建议你咨询专业律师。律师将根据你的具体情况提供个性化的建议和指导，帮助你制定合适的维权策略，并可以代表你与中介进行协商或提起诉讼。

总之，面对中介乱扣工资的问题，你需要保持冷静和理性，遵循法律程序来处理纠纷。通过明确合同关系、友好沟通、向相关部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等途径来维护自己的合法权益。同时，寻求专业律师的法律援助也是明智之举，以确保你的权益得到充分保障。