您好，关于您提出的“起诉变更监护权却判变更抚养权是否合法”的问题，这确实是一个涉及法律程序和实体权利的重要问题。首先，我们需要明确监护权和抚养权在法律上的定义及其区别，再结合具体案例和法律规定来进行分析。
一、监护权与抚养权的定义及区别
监护权：通常指的是对未成年人或无民事行为能力人的人身、财产及其他合法权益进行监督和保护的权利。监护权更多地涉及到对被监护人的全面照顾和管理，包括生活、教育、医疗等各个方面。
抚养权：则主要指的是父母对子女在经济上、生活上、教育上的抚养义务和权利。抚养权更侧重于经济支持和日常生活的照顾。
二、法律程序中的变更
在法律程序中，变更监护权和变更抚养权虽然都涉及到对未成年人权益的保护，但它们的侧重点和法律程序可能有所不同。然而，在实际操作中，由于监护权和抚养权在很多时候是紧密相连的，特别是在父母离婚或一方无法履行监护职责的情况下，法院在判决时可能会综合考虑多种因素，包括未成年人的身心健康、成长环境、父母的经济能力等，来决定是变更监护权还是抚养权，或者同时变更两者。
三、具体案例分析
以您提供的参考信息中的案例为例，当原监护人因涉及刑事犯罪被羁押，无法履行监护人职责时，法院在审理变更抚养关系纠纷时，会遵循有利于未成年人成长的原则，从有利于子女身心、保障子女的合法权益出发，依法确立未成年子女的抚养问题。在这种情况下，法院可能会判决变更抚养权，由另一方父母或其他有抚养能力的人来抚养未成年人，以确保其得到良好的照顾和教育。这种判决并不违背法律原则，而是根据实际情况和未成年人的最佳利益作出的合理判断。
四、合法性分析
因此，起诉变更监护权却判变更抚养权，在符合法律规定和未成年人最佳利益的前提下，是合法的。法院在判决时会综合考虑多种因素，包括未成年人的身心健康、成长环境、父母的经济能力等，来作出最有利于未成年人的判决。这种判决既体现了法律对未成年人权益的保护，也符合司法实践中的通常做法。
五、建议
如果您或他人面临类似情况，建议咨询专业律师，了解具体的法律程序和实体权利，以便更好地维护自己的合法权益和未成年人的最佳利益。同时，也希望您能理解法院在判决时所考虑的复杂因素和综合判断，共同为未成年人的健康成长创造良好的环境。