交通肇事罪立案后，即使达成赔偿和解，也必须依法向检察院提交相关材料，不能自行决定不提交。具体分析如下：

1. 刑事案件的立案与侦查程序具有法定性
   交通肇事罪属于公诉案件，一旦公安机关立案侦查，案件即进入刑事诉讼程序。根据《刑事诉讼法》第162条，公安机关需将侦查终结的案件移送检察院审查起诉，这是法定程序，不以当事人和解为转移。即使双方达成民事赔偿协议，公安机关仍需履行移送义务。

2. 和解的法律效力仅影响量刑，不终止刑事程序
   根据《刑事诉讼法》第288条，交通肇事案件中，犯罪嫌疑人、被告人真诚悔罪并赔偿损失、取得谅解的，可与被害人达成和解。但和解的法律后果是：

   • 检察院可依法提出从宽处罚建议（《刑事诉讼法》第290条）；
     
   • 法院可对被告人从宽处罚（《刑事诉讼法》第290条）。
     和解并不导致案件撤销或终止侦查、起诉，仅作为量刑情节考虑。

3. 例外情形：法定不起诉或酌定不起诉
   若案件符合《刑事诉讼法》第177条规定的情形（如情节轻微、危害不大），检察院可作出不起诉决定。但此决定权在检察院，需经审查后依法作出，而非由当事人协商决定。具体包括：

   • 法定不起诉：如犯罪已过追诉时效期限、经特赦令免除刑罚等；
     
   • 酌定不起诉：需同时满足“犯罪情节轻微”和“依照刑法规定不需要判处刑罚或免除刑罚”两个条件。
     即使达成和解，若案件不符合上述条件，检察院仍会提起公诉。

4. 实务建议

   • 当事人应积极配合公安机关、检察院的调查，主动提交和解协议、赔偿凭证等材料，争取从宽处理；
     
   • 切勿试图通过隐瞒和解情况或拒绝提交材料来逃避刑事责任，否则可能构成妨碍诉讼行为，面临更严厉处罚；
     
   • 若对案件处理有异议，可依法委托律师提出辩护意见或申请法律监督。

总结：交通肇事罪立案后，赔偿和解不能阻断案件向检察院的移送程序，但可作为量刑情节影响最终处理结果。当事人应依法配合诉讼进程，通过合法途径争取权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询。