劳动法中，员工严重违反公司制度通常涵盖以下几种情形：
严重违反劳动纪律：
- 多次旷工或长期无故缺勤：员工无正当理由连续旷工达到一定天数（如3-5天），或在一定周期内（如一个月或一个季度）累计旷工达到特定次数（如5-8次），这通常会被视为严重违反劳动纪律。长期无故缺勤，未经请假擅自离职或不按时到岗，也属于此类情形。
- 严重迟到、早退及擅自离岗：经常性的迟到、早退，如在一个月内累计达到10次以上，或在工作时间内未经批准擅自离开工作岗位，影响工作正常进行，同样被视为严重违纪。
损害公司利益：
- 严重失职或渎职行为：因工作疏忽或故意行为导致重大失误，给用人单位造成经济损失或不良影响，如玩忽职守引发事故、严重违反操作规程等。
- 侵占、挪用公司财产及接受商业贿赂：利用职务之便，将公司财物、资金占为己有或挪作他用，以及接受供应商或客户的贿赂，均属严重损害公司利益的行为。
- 伪造或篡改工作记录：包括伪造考勤记录、报销单据、业绩数据等，以骗取公司财物或荣誉，此类行为同样构成对公司利益的严重损害。
违反职业道德与保密义务：
- 泄露公司商业秘密：违反保密协议，将公司的技术秘密、客户信息、营销策略等泄露给外部人员，给公司带来经济损失和竞争压力。
- 违反竞业限制：在离职后到与本单位有竞争关系的企业工作或从事相关活动，违反竞业限制协议。
- 虚假报销及职务谋利：在费用报销时提供虚假的发票或报销内容，以及利用职务之便谋取私利，均属于违反职业道德的行为。
扰乱工作秩序与违反法律法规：
- 打架斗殴与恶意传播谣言：在工作场所内与他人发生打架斗殴行为，或编造并传播虚假信息，诋毁公司形象或其他员工名誉，严重影响工作秩序和员工安全。
- 拒不执行上级合理指示：经多次催告仍不服从管理，拒绝完成工作任务或履行岗位职责，破坏团队协作和工作效率。
- 违反法律法规：员工因盗窃、诈骗等犯罪行为被判刑，或被依法追究刑事责任，用人单位可据此解除劳动合同。
在判断员工是否严重违反公司制度时，还需注意以下几点：
- 公司制度的合法性：公司的规章制度必须是通过民主程序制定的，不违反法律法规的强制性规定。制度的制定要经过职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定，确保其合法有效。
- 制度的明确性：规章制度中应明确列举哪些行为构成“严重违反公司制度”，避免模糊不清。例如，具体规定旷工天数、泄露商业机密的程度等。
- 制度的公示与告知：公司必须证明已将规章制度有效告知员工，通常通过员工签字确认、组织培训、内部公示等方式。如果公司无法证明已履行告知义务，依据该制度辞退员工可能不被法律认可。
- 事实依据与证据充分：公司必须有充分的证据证明员工确实实施了严重违反规章制度的行为，如打卡记录、视频监控、证人证言等。仅凭口头说法而无实质证据，难以支撑辞退决定的合法性。
若员工被公司以严重违反公司制度为由辞退，员工应如何应对：
- 了解制度内容与自身权益：员工应详细了解公司声称自己违反的制度条款，确认其合理性、合法性及自己的行为是否真的构成严重违规。
- 收集证据：如认为辞退不合理，员工应积极收集对自己有利的证据，如工作交接文件、沟通邮件、未收到制度手册或未参加培训的证据等。
- 与公司协商：尝试与公司进行友好协商，表达看法，说明情况，看是否能达成和解，如恢复劳动关系或获得合理补偿。
- 法律途径维权：若协商不成，员工可向劳动监察部门投诉，申请劳动仲裁，要求支付违法解除劳动合同的赔偿金等；对仲裁结果不满意，还可向法院提起诉讼。
希望以上解答能对你有所帮助。如果你有任何其他法律问题，尤其是离婚财产纠纷、劳动纠纷、合同纠纷领域的问题，都可以直接向我咨询。