使用虚假发票在公司进行报销是严重违法的行为，这一行为不仅违反了基本的商业道德和诚信原则，还可能触犯我国的多部法律法规，带来严重的法律后果。以下是对此问题的详细分析：
一、法律后果
民事层面：
- 使用虚假发票报销违反了与用人单位的劳动合同中关于诚实守信、遵守财务制度的约定，用人单位有权依据合同和规章制度进行处理，如解除劳动合同、追回不当报销款项等。
行政层面：
- 根据《中华人民共和国发票管理办法》，禁止使用虚假发票。税务机关可对开具或使用虚假发票的单位和个人没收违法所得，并根据虚开金额处以罚款，最高可达50万元；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
- 根据《财政违法行为处罚处分条例》，以虚报、冒领等手段骗取财政资金支出的，将被责令改正、追回资金，并对单位和个人给予警告、通报批评、记大过、降级、撤职、开除等处分。
刑事层面：
- 虚开发票罪：若没有实际业务发生而开具发票，或与实际业务不符时伪造、变造、隐瞒事实真相非法开具发票，将视情节轻重处以有期徒刑、拘役及罚金，最高可至无期徒刑并没收财产。
- 职务侵占罪：公司、企业或其他单位人员利用职务便利，使用虚假发票报销将本单位财物非法占为己有，数额较大的，将依据数额大小处以有期徒刑、拘役及罚金。
- 贪污罪：国家工作人员利用职务便利，使用虚假发票报销侵吞公共财物的，根据贪污数额和情节严重程度，将处以有期徒刑、拘役、罚金或没收财产，最高可至死刑。
- 诈骗罪：以非法占有为目的，通过虚构事实或隐瞒真相使用虚假发票报销骗取他人财物，达到一定数额标准的，将视数额和情节处以有期徒刑、拘役、管制、罚金或没收财产。
二、司法机关认定
司法机关在审查虚假报销行为时，会重点关注有无实际消费及该消费是否与工作相关。假发票、涂改发票、连号发票及无法证实实际消费的发票均被视为虚假报销的证据。
三、建议与防范措施
企业层面：
- 建立健全内部控制制度，包括定期自查自纠机制，以有效防范虚开发票和报销欺诈行为。
- 加强对报销凭证的审查力度，确保报销活动的合法性和规范性。
员工层面：
- 增强法律意识，严格遵守法律法规和单位规定，避免任何形式的虚假报销行为。
- 在报销费用时务必使用真实有效的发票，确保报销活动的真实性和合法性。
总结：使用虚假发票在公司进行报销是严重违法的行为，不仅损害企业和国家利益，还可能导致个人面临严厉的法律制裁。因此，务必严格遵守相关法律法规和单位规定，诚信为本，合法合规地进行财务报销。