关于小区店铺开后门是否合法的问题，这并非一个简单的“是”或“否”的答案，而是需要根据具体情况和相关法律法规来综合判断。
首先，从一般原则来说，小区店铺开后门需要遵守相关的建筑规划和城市管理法规。如果店铺在建造时并未设计后门，或者后门的设计、开设未经相关部门批准，那么私自开设后门就可能构成违规行为。
以您提供的参考信息为例，裕安区豪门花园小区的两家餐饮商铺私开后门，就引发了油烟直排和噪声扰民等问题，严重影响了居民的日常生活。在这种情况下，城管部门介入调查，并责令商铺立即停止整改私设的后门，恢复原状。这表明，私自开设后门，特别是当这种行为对周边环境和居民生活造成负面影响时，是不被允许的。
那么，什么情况下小区店铺可以开后门呢？这通常需要满足以下条件：
符合建筑规划：店铺的后门设计应符合原始的建筑规划，或者已经通过合法的程序进行了规划变更。
获得相关部门批准：在开设后门之前，需要向城市规划、建设、消防等相关部门提出申请，并获得他们的批准。
不影响周边环境和居民生活：后门的开设不应导致油烟直排、噪声扰民、安全隐患等问题，应确保不会对周边环境和居民生活造成负面影响。
因此，如果您是小区店铺的业主或经营者，想要开设后门，建议您先咨询当地的城市规划、建设、消防等相关部门，了解具体的规定和要求，并按照规定的程序进行申请和审批。
总的来说，小区店铺开后门是否合法，取决于是否符合建筑规划、是否获得相关部门批准以及是否影响周边环境和居民生活。在未经批准或不符合规定的情况下私自开设后门，可能会面临法律责任和整改要求。