起诉款回来执行庭拦截是否合法，需分情况讨论：
合法拦截的情形：
- 存在其他债权或债务纠纷：如果执行庭在拦截起诉款时，发现存在其他合法债权或债务纠纷，且该纠纷与起诉款有关联，例如存在优先受偿权、担保物权等情形，执行庭有权根据相关法律法规和司法解释，对起诉款进行拦截或暂缓分配，以确保其他债权人的合法权益得到保障。
- 涉及刑事犯罪或违法活动：如果起诉款涉及刑事犯罪或违法活动，如诈骗、洗钱等，执行庭在接到相关司法机关的通知或协助执行请求后，有权对起诉款进行拦截，并配合司法机关进行调查和处理。
- 执行程序中的合法扣留：在执行过程中，如果被执行人存在逃避执行、转移财产等行为，执行庭有权根据《中华人民共和国民事诉讼法》等相关法律法规的规定，对被执行人的财产进行扣留、冻结等措施，包括起诉款。这种情况下，拦截起诉款是合法的执行行为。
非法拦截的情形：
- 无合法依据拦截：如果执行庭在没有合法依据的情况下拦截起诉款，例如没有接到相关司法机关的通知或协助执行请求，也没有发现存在其他债权或债务纠纷、刑事犯罪或违法活动等情形，那么这种拦截行为就是非法的。
- 超越职权范围拦截：执行庭在执行过程中，必须严格遵守法律法规和司法解释的规定，不得超越职权范围进行拦截。如果执行庭超越了其职权范围，对起诉款进行了非法拦截，那么这种行为也是违法的。
法律背景与建议：
- 法律背景：根据《中华人民共和国民事诉讼法》等相关法律法规的规定，执行庭在执行过程中有权对被执行人的财产进行查封、扣押、冻结等措施，但必须严格遵守法定程序和条件。如果执行庭在拦截起诉款时违反了法律法规的规定，就可能构成非法拦截。
- 建议：如果您认为执行庭对起诉款的拦截行为存在非法情形，您可以向执行庭提出异议，要求其说明拦截的合法依据和理由。如果执行庭无法提供合法依据或理由不充分，您可以向上一级人民法院申请复议或提起执行异议之诉，以维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果执行庭的拦截行为被认定为合法，那么起诉款可能会被暂缓分配或用于清偿其他债务或刑事犯罪相关费用。
- 如果执行庭的拦截行为被认定为非法，那么执行庭可能需要承担相应的法律责任，如赔偿损失、恢复原状等。同时，您也有权要求执行庭立即停止非法拦截行为，并返还被拦截的起诉款。
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