在建设工程合同中，实际施工人与承包人签订的挂靠协议一般是无效的。以下从多个角度进行分析：
一、法律背景与规定
根据《中华人民共和国建筑法》及相关司法解释，挂靠行为，即没有资质的实际施工人借用有资质的建筑施工企业名义承揽工程，是明确被禁止的。这种行为不仅违反了建筑市场的准入制度，也损害了建筑市场的公平竞争秩序。因此，从法律层面来看，挂靠协议因违反法律强制性规定而无效。
二、挂靠协议无效的法律后果
合同无效后的处理原则：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，无效的合同自始没有法律约束力。因此，挂靠协议一旦被认定为无效，将自始不产生法律效力，双方基于该协议所取得的财产应当予以返还，不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。有过错的一方应当赔偿对方因此所受到的损失，双方都有过错的，应当各自承担相应的责任。
实际施工人的权益保护：虽然挂靠协议无效，但实际施工人作为工程的实际建设者，其投入的人力、物力和财力应当得到合理的保护。在实际操作中，如果工程已经竣工并验收合格，实际施工人可以参照合同约定向承包人主张工程款。同时，如果因挂靠行为导致实际施工人遭受损失，如因承包人原因导致工程款无法及时支付等，实际施工人也有权要求承包人承担相应的赔偿责任。
承包人的法律责任：承包人作为被挂靠方，允许实际施工人借用其资质承揽工程，不仅违反了法律规定，也损害了建筑市场的公平竞争秩序。因此，承包人应当承担相应的法律责任，包括但不限于行政处罚、民事赔偿等。如果因挂靠行为导致工程质量问题或安全事故等严重后果，承包人还可能面临刑事责任的追究。
三、实际案例与司法实践
在司法实践中，法院对于挂靠协议的效力认定通常持严格态度。一旦查实存在挂靠行为，法院往往会直接认定挂靠协议无效，并依据相关法律规定和案件事实，对双方的权利义务进行重新分配和调整。因此，对于实际施工人和承包人而言，签订挂靠协议并非明智之举，不仅可能面临法律风险，还可能因协议无效而遭受经济损失。
四、建议与风险提示
避免挂靠行为：对于实际施工人而言，应当避免通过挂靠方式承揽工程，而是应当通过合法途径取得相应的施工资质，并按照法律规定参与建筑市场的竞争。
谨慎签订合同：在签订建设工程合同时，双方应当仔细审查合同条款，确保合同内容合法合规，并明确双方的权利义务关系。避免签订存在法律风险的合同条款，如挂靠协议等。
及时咨询专业律师：如果在实际操作中遇到法律问题或纠纷，建议及时咨询专业律师的意见和建议。律师可以根据案件事实和法律规定，为当事人提供专业的法律服务和支持，帮助当事人维护自身合法权益。
作为李琼利律师，我专注于刑事辩护和合同纠纷领域。如果你在建设工程合同方面遇到任何法律问题或纠纷，欢迎直接向我咨询。