在行政案件中，如果被告（通常是行政机关）超过了举证期限，这是一个涉及诉讼程序公正性和双方权益的重要问题。以下是对此问题的详细解答：
一、一般规则与举证责任
根据《中华人民共和国行政诉讼法》及其相关司法解释，被告对作出的行政行为负有明确的举证责任。这意味着，被告需要在收到起诉状副本之日起的十五日内，向人民法院提交作出该行政行为的全部证据以及所依据的规范性文件，并同时提出答辩状。这一规定确保了行政诉讼程序的有序进行，并督促行政机关及时、全面地履行其举证义务，从而有效保护行政相对人（即原告）的合法权益。
如果被告在规定的期限内无正当理由未提供或逾期提供证据，法院将视为被告没有相应证据。在这种情况下，法院可能会据此作出不利于被告的判决或裁定，因为行政行为的合法性需要由被告来举证证明。
二、特殊情况下的延期举证
尽管有上述一般规则，但在某些特殊情况下，被告可能因不可抗力（如自然灾害、战争等）或客观上不能控制的其他正当事由（如关键证人突然失踪、重要证据需海外调取等）而无法在规定的期限内提供证据。在这种情况下，被告可以在收到起诉状副本之日起十五日内向人民法院提出延期提供证据的书面申请。
人民法院将根据具体情况，决定是否准许延期举证。如果申请被准许，被告应在正当事由消除后的合理时间内（通常为十五日）提供证据。这一规定体现了法律对特殊情况的灵活处理，确保了诉讼的公正性和合理性。
三、逾期举证的实际影响
当被告超过诉讼期限举证且不存在正当理由时，其提交的证据很可能不被法院接受和采信。这对于被告而言是极为不利的，因为行政行为的合法性需要由被告来举证证明。一旦关键证据因逾期举证而不被认可，法院将基于现有证据（往往对原告更为有利）来认定行政行为的合法性和合理性。
例如，在行政处罚类行政诉讼案件中，如果行政机关未能在规定时间内提交证明其处罚所依据事实的证据，法院很可能会撤销该行政处罚决定，从而维护原告的合法权益。
四、建议与策略
严格遵守举证期限：被告应严格遵守法律规定的举证期限，确保及时、全面地提交证据和答辩状。
及时申请延期举证：如遇特殊情况无法按时举证，被告应及时向法院申请延期，并提供充分的理由和证据支持其申请。
积极行使质证权利：原告应积极行使自己的权利，对被告提供的证据进行质证和反驳，确保诉讼双方的权益平衡。
寻求专业法律帮助：对于涉及行政诉讼的案件，建议当事人尽早咨询专业的律师或法律顾问，以便更好地了解自己的权利和义务，制定有效的诉讼策略。
综上所述，行政案件中超过举证期限是一个需要严肃对待的问题。被告应严格遵守法律规定，确保及时举证；如遇特殊情况，应及时申请延期并说明理由；同时，原告也应积极行使自己的权利，对被告提供的证据进行质证和反驳。