生态环境行政处罚从立案到决定的最长期限一般为九十日，但法律另有规定的除外。以下是对这一问题的详细分析：

一、一般期限规定

根据《生态环境行政处罚办法》的相关规定，生态环境主管部门对涉嫌违反生态环境保护法律、法规和规章的违法行为，应当及时立案。从立案到作出行政处罚决定，通常有一定的时间限制。在一般情况下，这个期限是九十日。这意味着，从立案之日起，生态环境主管部门应在九十日内完成调查取证、审查决定等程序，并作出行政处罚决定。

二、特殊情形下的期限延长

1. 法律另有规定：如果相关法律、法规或规章对行政处罚的期限有特别规定，那么应遵循这些特别规定。例如，某些特定类型的环境违法行为可能由于调查复杂、取证困难等原因，需要更长的处理时间。

2. 案件复杂或特殊情况：在实际操作中，如果案件特别复杂或存在其他特殊情况，如需要等待其他部门的鉴定结果、涉及多个违法主体等，生态环境主管部门可能会根据实际情况适当延长处理期限。但这种延长并非无限制，通常需要经过上级部门的批准，并会告知当事人延长的理由和期限。

三、期限计算的注意事项

1. 期间开始日：根据法律规定，期间开始的日不计算在期间内。因此，在计算生态环境行政处罚的期限时，应从立案的次日起算。

2. 期间届满日：期间届满的最后一日是节假日的，应以节假日后的第一日为期间届满的日期。这确保了当事人有足够的时间来准备和应对行政处罚。

四、法律建议

1. 及时了解案件进展：如果当事人涉嫌违反生态环境保护法律、法规和规章，并已被生态环境主管部门立案调查，建议及时了解案件进展情况，包括调查取证、审查决定等各个环节的时间节点。

2. 积极配合调查：在调查过程中，当事人应积极配合生态环境主管部门的工作，提供必要的证据和资料，以便尽快查明事实真相。

3. 依法维护权益：如果当事人对行政处罚决定不服，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自己的合法权益。

在实际操作中，如果遇到生态环境行政处罚期限相关的问题或疑虑，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。