结论：在工程建设中，二包（即分包商）虚开发票并将机械款挪用是违法的，可能涉及虚开发票罪和挪用资金罪等多个罪名。

详细分析：

1. 虚开发票罪：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条，虚开增值税专用发票或者虚开用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的，将面临严厉的刑事处罚。对于虚开本法第二百零五条规定以外的其他发票，情节严重的，同样会受到刑事处罚。
   • 行为分析：二包作为分包商，如果虚开发票，即无真实交易背景而开具发票，或者开具与实际交易不符的发票，均构成虚开发票行为。这种行为不仅违反了税收管理法规，也损害了国家税收利益。

2. 挪用资金罪：

   • 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》第二百七十二条，公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，挪用本单位资金归个人使用或者借贷给他人，数额较大、超过三个月未还的，或者虽未超过三个月，但数额较大、进行营利活动的，或者进行非法活动的，构成挪用资金罪。
   • 行为分析：二包在工程建设中，如果利用职务便利，将机械款挪用，即未经合法程序将本应支付给供应商或用于工程建设的资金用于个人用途或其他非法用途，且数额较大或进行营利活动、非法活动的，将构成挪用资金罪。

3. 法律后果：

   • 刑事处罚：对于虚开发票罪和挪用资金罪，根据犯罪情节的严重程度，犯罪者可能面临有期徒刑、拘役、罚金甚至没收财产等刑事处罚。
   • 民事赔偿：除了刑事处罚外，犯罪者还可能需要承担民事赔偿责任，即赔偿因虚开发票和挪用资金行为给受害方造成的损失。

4. 建议与措施：

   • 加强内部管理：工程建设单位应加强对分包商的管理和监督，确保分包商遵守税收管理法规和财务管理制度，防止虚开发票和挪用资金等违法行为的发生。
   • 完善合同条款：在与分包商签订合同时，应明确约定发票开具和资金使用的相关条款，要求分包商提供真实、合法的发票，并按照合同约定使用资金。
   • 及时举报与维权：如果发现分包商存在虚开发票和挪用资金等违法行为，工程建设单位应及时向相关部门举报，并依法维护自己的合法权益。

进一步思考：

• 在工程建设领域，由于涉及资金量大、交易复杂，因此更容易出现虚开发票和挪用资金等违法行为。工程建设单位应加强对相关法律法规的学习和宣传，提高员工的法律意识和风险防范能力。
• 对于分包商而言，应严格遵守税收管理法规和财务管理制度，诚信经营、合法纳税。任何试图通过虚开发票和挪用资金等违法行为来谋取私利的行为，都将受到法律的严厉制裁。

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