物流公司额外收取转运费是否合法，需视具体情况而定。以下从不同角度为您详细分析：

一、合同约定角度

1. 若合同中有明确约定：如果物流服务合同中明确规定了转运费的收取标准、条件及方式，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么物流公司按照合同约定收取转运费是合法的。在这种情况下，您作为客户应当遵守合同约定，支付相应的转运费。

2. 若合同中无明确约定：如果物流服务合同中没有明确约定转运费的收取，那么物流公司额外收取转运费可能缺乏合同依据。此时，您可以与物流公司协商，要求其提供合理的收费依据或拒绝支付该费用。如果协商无果，您可以考虑通过法律途径解决争议。

二、法律法规角度

1. 遵循公平、合理原则：根据《中华人民共和国民法典》等相关法律法规，物流公司在提供服务时应当遵循公平、合理的原则，不得滥用市场支配地位或采取不正当手段损害客户利益。如果物流公司额外收取的转运费明显不合理，超出了正常服务成本的范围，那么该行为可能构成不公平交易，您有权拒绝支付或要求物流公司退还。

2. 禁止乱收费行为：物流行业作为服务行业，应当遵守相关法律法规和行业规范，禁止乱收费行为。如果物流公司未经客户同意擅自收取转运费，或者收取的费用与提供的服务不符，那么该行为可能违反了相关法律法规的规定，您有权向相关部门投诉或寻求法律援助。

三、实际操作建议

1. 审查合同条款：在签订物流服务合同时，务必仔细审查合同条款，特别是关于费用的收取部分。确保合同中明确规定了各项费用的收取标准、条件及方式，以避免后续产生争议。

2. 保留相关证据：在与物流公司沟通或交易过程中，务必保留好相关证据，如合同、发票、聊天记录等。这些证据在后续解决争议时将起到关键作用。

3. 及时沟通协商：如果发现物流公司存在额外收取转运费的情况，首先应当与物流公司进行沟通协商，要求其提供合理的收费依据或解决方案。如果协商无果，再考虑采取其他措施。

4. 寻求法律援助：如果物流公司的行为严重损害了您的利益，且无法通过协商解决争议，您可以考虑寻求法律援助或向相关部门投诉。在寻求法律援助时，请务必提供充分的证据和详细的情况说明，以便律师或相关部门能够更好地了解案情并为您提供帮助。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。作为专业律师，我将竭诚为您提供法律支持。