店长私吞公款可能涉及职务侵占罪或贪污罪，具体立案标准需根据主体身份和金额确定，以下是详细分析：

1. 若店长属于公司、企业或其他单位工作人员（非国家工作人员）
   可能构成职务侵占罪，立案标准为：

   • 侵占数额在3万元以上的，应予立案追诉（《最高人民法院、最高人民检察院关于办理贪污贿赂刑事案件适用法律若干问题的解释》第十一条）。
     
   • 需注意：若店长利用职务便利，将本单位财物非法占为己有，且数额达到上述标准，即符合刑事立案条件。

2. 若店长具有国家工作人员身份（如国有公司、企业中从事公务的人员）
   可能构成贪污罪，立案标准为：

   • 贪污数额在3万元以上，或贪污数额在1万元以上不满3万元但具有特定情节（如贪污救灾、抢险款物等），应予立案追诉（《最高人民法院、最高人民检察院关于办理贪污贿赂刑事案件适用法律若干问题的解释》第一条）。
     
   • 需注意：国家工作人员身份的认定需结合具体职责和单位性质判断。

3. 关键证据与程序

   • 无论哪种罪名，立案均需满足“有证据证明有犯罪事实”的条件，建议收集以下证据：
     
     • 店长侵占财物的书面记录（如账目、合同、转账记录）；
       
     • 证人证言（如同事、财务人员）；
       
     • 店长承认侵占的录音、聊天记录等；
       
     • 单位财物被侵占的审计报告或鉴定意见。
       
   • 程序上：需向公安机关经济犯罪侦查部门报案，由公安机关审查后决定是否立案。

建议：若发现店长私吞公款，应尽快固定证据并报警，同时可委托律师协助调查取证、与司法机关沟通，以维护单位合法权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。