结论：车管所内部未消除加装记录，但行驶证和实车已无加装的情况，一般不会直接影响商业险三责的赔付，但具体是否赔付还需结合保险合同条款、事故原因及保险公司的核定情况来确定。以下从不同角度为您详细分析：

1. 保险合同条款的角度：

   • 商业险三责的赔付主要依据的是保险合同的约定。保险合同中通常会明确列明保险责任、免责条款以及赔付条件等。
   • 如果保险合同中并未将“车管所内部加装记录未消除”作为免责条款，那么这一情况本身不应成为保险公司拒绝赔付的理由。
   • 但需注意，如果保险合同中有关于车辆改装、加装等变更需及时通知保险公司的条款，且您未履行通知义务，那么在发生事故时，保险公司可能会据此主张免责或部分免责。

2. 事故原因与加装记录的关系：

   • 商业险三责的赔付还取决于事故的原因是否与加装有关。如果事故是由加装部分直接导致的，那么即使行驶证和实车已无加装，保险公司也可能以事故与加装有关为由拒绝赔付或部分赔付。
   • 如果事故与加装无关，那么车管所内部未消除加装记录的情况更不应成为赔付的障碍。

3. 保险公司的核定与举证责任：

   • 在发生事故后，保险公司会进行核定，以确定是否属于保险责任范围。在这个过程中，保险公司可能会要求您提供相关证据，如行驶证、车辆照片等，以证明车辆的实际状态。
   • 如果保险公司以车管所内部未消除加装记录为由拒绝赔付，那么它需要承担举证责任，证明这一情况与事故的发生有直接关系，或者证明您未履行保险合同中的相关义务。

4. 实际操作建议：

   • 在处理此类情况时，建议您首先仔细审查保险合同条款，了解保险责任和免责条款的具体内容。
   • 如果保险公司拒绝赔付或提出异议，您可以要求保险公司提供详细的核定报告和拒绝赔付的理由。
   • 如果您认为保险公司的拒绝赔付理由不成立，您可以考虑通过法律途径维护自己的权益，如向当地保险监管部门投诉或提起诉讼。

额外提醒：为了避免类似纠纷的发生，建议您在车辆进行改装或加装后，及时到车管所办理相关变更手续，并更新行驶证上的信息。同时，在购买商业险时，也应如实告知保险公司车辆的实际情况和变更情况，以确保保险合同的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。