结论前置：诊所违规销售三类医疗器械，工商部门将依据相关法律法规进行严厉处罚，包括但不限于责令停止经营、没收违法所得与产品、罚款，甚至可能面临刑事责任。
一、处罚依据与措施
根据《医疗器械监督管理条例》及相关法律法规，对于诊所违规销售三类医疗器械的行为，工商部门将采取以下处罚措施：
责令停止经营：监管部门会首先责令诊所立即停止所有违规销售三类医疗器械的活动，以防止危害进一步扩大。
没收违法所得与物品：
- 没收违法所得：即没收诊所因违规销售三类医疗器械所获得的全部收入。
- 没收物品：包括违规销售的三类医疗器械本身，以及用于违规销售的工具、设备、原材料等物品。
罚款：
- 具体罚款金额依据违法情节的严重程度和货值金额确定。若货值金额较小，将并处一定数额的罚款；若货值金额较大，则并处货值金额数倍以上的罚款。
- 情节严重的，还可能面临更高的罚款金额，甚至可能被吊销营业执照。
其他行政处罚：除了上述措施外，还可能面临撤销相关批准文件、限制经营活动等其他行政处罚。
二、可能涉及的其他责任
民事赔偿责任：
- 如果违规销售的三类医疗器械对消费者造成人身、财产损害，诊所需依法承担民事赔偿责任，赔偿消费者的损失。
刑事责任：
- 若违规销售行为情节严重，扰乱市场秩序，可能触犯《中华人民共和国刑法》中的非法经营罪。依据相关法律规定，情节严重的，可处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，可处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。
三、对诊所的建议
- 诊所应严格遵守相关法律法规，确保合法合规经营。在销售医疗器械时，应仔细核对产品资质和许可证，确保所售产品符合法律法规要求。
- 如遇工商部门检查或消费者投诉，应积极配合调查处理，及时整改违规行为。
- 诊所应加强内部管理，建立健全的医疗器械销售管理制度和流程，确保销售活动的合法性和规范性。
综上所述，诊所违规销售三类医疗器械将面临严厉的处罚和可能的民事、刑事责任。建议诊所务必遵守相关法律法规，确保合法合规经营。如有任何法律问题或疑问，可直接向我咨询。