结论：在强制执行过程中，若被执行人分期还款但后续不愿意继续履行，法院是有可能采取强制拍卖等进一步执行措施的，但具体是否会拍卖，需结合多种因素综合判断。以下从不同角度为你详细分析：

从执行程序的一般规定来看

根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，在强制执行程序中，法院会责令被执行人报告财产情况，并根据申请执行人的申请或依职权调查被执行人的财产。如果被执行人有可供执行的财产，如房产、车辆等，且其未按执行通知书指定的期间履行生效法律文书确定的给付义务，法院有权采取查封、扣押、冻结、拍卖、变卖等执行措施。

举例：假设法院判决被执行人需偿还申请执行人 50 万元债务，在强制执行阶段，双方达成分期还款协议，被执行人先偿还了 20 万元后不再履行。此时，若被执行人名下有房产，法院在查明情况后，为了保障申请执行人的合法权益，很可能会对该房产进行查封，并在符合条件时启动拍卖程序。

从分期还款协议的性质和履行情况来看

分期还款协议本质上是双方对原生效法律文书履行方式的一种变更约定。如果被执行人能够按照协议按时足额还款，那么一般不会引发进一步的强制执行措施。但一旦被执行人违反协议，不愿意继续还款，就构成了对新的履行约定的违约。

法律后果分析：此时，申请执行人可以向法院申请恢复原生效法律文书的执行，或者依据分期还款协议向法院申请强制执行剩余款项。法院在审查后，若认为被执行人存在恶意逃避债务等情形，会加大执行力度，包括对被执行人财产的处置，拍卖就是常见的处置方式之一。

从保障双方合法权益和执行效率的角度考虑

法院在执行过程中，既要保障申请执行人的债权得以实现，也要兼顾被执行人的基本生活需求和合法权益。如果被执行人确实因客观原因暂时无法继续履行分期还款义务，且能提供相应证据证明，法院可能会根据具体情况，给予一定的宽限期或者调整执行方案。

举例：被执行人因突发重大疾病导致经济困难，无法按分期还款协议继续还款，并向法院提供了医疗证明等相关证据。在这种情况下，法院可能会暂缓拍卖等强制执行措施，组织双方进行协商，寻求更合理的解决方案，如延长还款期限、调整还款金额等。

然而，如果被执行人没有合理的理由拒绝继续还款，且存在转移、隐匿财产等妨碍执行的行为，法院为了维护法律尊严和申请执行人的合法权益，会迅速采取强制拍卖等措施，尽快实现债权。

建议：如果你作为申请执行人遇到这种情况，要及时向法院提供被执行人违反分期还款协议的证据，申请法院恢复执行或采取进一步措施；如果你是被执行人，确实有困难无法继续履行，应主动与申请执行人沟通协商，并向法院说明情况，争取达成新的和解方案，避免法院采取更严厉的执行措施。

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