工程合同层层分包的有效性需根据具体情况综合判断，但通常情况下，层层分包（尤其是二次分包及以后）的合同是无效的。以下是对这一问题的详细分析：
有效工程分包合同需满足的条件
主体合法：
- 分包单位必须持有相应的专业承包资质证书或劳务分包资质证书，这是确保分包工程质量和安全的基础。
- 合同双方应具备完全的民事行为能力和签约权限，确保合同的签订是出于双方真实且合法的意愿。
意思表示真实：
- 合同双方在签订分包合同时，应基于平等、自愿的原则进行协商，并就分包工程的范围、价款、工期等核心条款达成一致意见。
- 合同中不得存在欺诈、胁迫或重大误解等导致意思表示不真实的情形。
内容合法：
- 分包的工程必须是法律允许分包的部分，且不得违反总承包合同的约定（除非经建设单位认可）。
- 合同条款应遵守法律、行政法规的强制性规定，不得损害国家利益、社会公共利益或他人合法权益。
- 关于工程质量标准的约定，必须达到或超过国家规定的强制性标准。
程序合法：
- 对于需要办理审批、备案等手续的工程分包合同，应按照相关规定及时办理，确保合同的合法性。
层层分包合同无效的常见情形
违法分包：
- 二次分包及以后：分包单位将其承包的工程再分包（即“二次分包”及以后），这种层层分包的行为违反了法律规定，因此合同无效。
- 主体不合格：总承包单位将工程分包给不具备相应资质条件的单位或个人。
- 未经同意分包：在建设工程总承包合同中未有约定，又未经建设单位认可，承包单位擅自将其承包的部分建设工程交由其他单位完成。
- 主体结构分包：施工总承包单位将建设工程主体结构的施工（钢结构工程除外）分包给其他单位，因主体结构施工关乎建筑物安全，必须由总承包单位自行完成。
转包：
- 承包单位在承接工程后，不履行合同约定的责任和义务，而是将整个工程或工程的一部分以分包的名义转给其他单位承包。这种行为因违反法律的强制性规定而无效。
借用资质：
- 没有资质的实际施工人借用有资质的建筑施工企业名义与他人签订工程分包合同。这种合同因涉及欺诈和违反法律规定而无效。
实际应用中的建议
- 严格审查资质：在签订工程分包合同时，双方应仔细审查对方的资质和签约权限，确保合同的主体合法。
- 明确合同条款：双方应充分协商并明确合同条款，确保意思表示真实且内容合法。特别是关于分包工程的范围、价款、工期等核心条款，应达成一致意见并明确写入合同。
- 履行法定程序：对于需要办理审批、备案等手续的分包合同，应及时办理相关手续以确保程序的合法性。
- 避免层层分包：尽量减少分包层次，避免二次分包及以后的行为，以降低合同无效的风险并保障双方的合法权益。
层层分包（尤其是二次分包及以后）的工程合同通常是无效的。在实际操作中，双方应严格遵守相关法律法规和合同条款，确保合同的合法性和有效性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。