关于您提出的“提交了代理推荐函是否还需要提交村民证明”的问题，这主要取决于具体的申请或比选流程要求，而这两个流程可能因不同的项目或机构而有所差异。不过，我可以根据您提供的两个参考信息场景，给出一般性的分析和建议。
对于揭阳市工程技术研究中心申报认定工作：
在揭阳市工程技术研究中心的申报认定流程中，主要关注的是申报单位的资质、科研成果、研发投入、科研条件以及管理机制等方面。从提供的参考信息来看，申报过程中需要提交一系列与这些方面相关的证明材料，如营业执照、财务审计报告、研发费用投入证明、知识产权材料等。然而，并未提及需要提交代理推荐函或村民证明。因此，在这个场景下，如果已经按照要求提交了所有必要的申报材料，那么通常不需要额外提交代理推荐函或村民证明。
对于岗巴县龙中乡当嘎村房屋提升项目招标代理机构比选：
在招标代理机构比选的流程中，比选人主要关注的是代理机构的资质、业绩、商业信誉、财务会计制度以及依法缴纳税收和社会保障资金的记录等方面。从提供的参考信息来看，比选过程中需要提交的材料包括公司营业执照、法人身份证复印件、类似项目公开招标代理业绩的证明材料等。同样，这里也并未提及需要提交村民证明。至于代理推荐函，它可能不是比选流程中的必需材料，除非比选公告或相关文件中明确要求提交。
一般性建议：
仔细阅读比选或申报公告：这是了解具体要求和所需材料的最直接途径。公告中通常会详细列出需要提交的所有材料清单。
咨询相关机构或人员：如果对公告中的要求有疑问或不确定，可以联系比选人或申报机构的相关人员（如科技局工作人员、比选组织者等）进行咨询。
准备齐全且符合要求的材料：根据公告要求，准备所有必要的材料，并确保它们的真实性和有效性。如果公告中没有明确要求提交代理推荐函或村民证明，那么通常不需要额外准备这些材料。
综上所述，在大多数情况下，如果已经按照比选或申报公告的要求提交了所有必要的材料，那么通常不需要额外提交代理推荐函或村民证明。然而，为了确保万无一失，建议您仔细阅读相关公告并咨询相关机构或人员以获取最准确的信息。