关于主人家卖有祠堂的房子是否违法的问题，这主要取决于祠堂的建设是否合法以及房屋的整体产权情况。以下是从不同角度进行的分析：

1. 祠堂建设的合法性：

   • 合法建设：如果祠堂的建设是经过相关部门审批，并获得了建设工程规划许可证等必要证件，且符合当地乡村或城市的整体规划布局，没有超出宅基地范围，也没有违反土地用途规定和其他相关规定，那么祠堂的建设就是合法的。在这种情况下，卖有祠堂的房子通常不会因祠堂本身而违法。
   • 违法建设：如果祠堂的建设未经审批擅自进行，或者不符合规划要求、超出了宅基地范围、违反了土地用途规定或其他相关规定，那么祠堂的建设就是违法的。在这种情况下，卖有违法建设祠堂的房子可能会涉及违法问题，因为房屋的整体产权可能受到祠堂违法建设的影响。

2. 房屋整体产权情况：

   • 产权清晰：如果房屋（包括祠堂部分）的产权清晰，没有争议，且祠堂的建设合法，那么卖这样的房子通常是合法的。
   • 产权有争议或受限：如果房屋的产权存在争议，或者受到某些限制（如抵押、查封等），或者祠堂的建设违法导致房屋整体产权受到影响，那么卖这样的房子可能会涉及违法问题。

法律后果与建议：

• 法律后果：如果卖有违法建设祠堂的房子，可能会面临行政处罚，如责令停止交易、限期改正等。如果因此侵犯了他人的合法权益，还可能承担民事责任。
• 建议：在决定卖有祠堂的房子之前，务必确保祠堂的建设合法，且房屋的整体产权清晰无争议。如果祠堂的建设存在违法情况，应先进行整改并获得相关部门的批准后再进行交易。同时，建议咨询当地的土地管理部门或法律专业人士（如我，代雨庭律师，专注于房产等领域），以了解清楚相关规定和要求，避免不必要的法律风险。

总结来说，主人家卖有祠堂的房子是否违法，取决于祠堂的建设是否合法以及房屋的整体产权情况。在交易前务必进行充分的调查和咨询，以确保交易的合法性和安全性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。