针对您提出的问题，即父子已分户且拥有两个户口本、两处宅基地，均合法取得的情况下，能否都将宅基地确到父亲一人名下，以下是我的详细解答：

首先，我们需要明确宅基地的权属性质。宅基地属于村集体所有，村民仅拥有使用权，而不拥有所有权。这意味着，宅基地本身并不能作为遗产进行继承，因为它不属于被继承人的合法财产范畴。然而，宅基地上的房屋是村民的私有财产，是可以被继承的。

接下来，我们分析您的情况。父子已经分户，且各自拥有独立的户口本和宅基地证，这表明两处宅基地都是合法取得的。在这种情况下，将两处宅基地都确权到父亲一人名下，从法律和政策的角度来看，是不被允许的。因为宅基地的使用权是与户口本上的家庭成员相关联的，每个家庭成员都有权在符合规定的情况下使用宅基地。

此外，宅基地的确权登记是遵循“一户一宅”的原则的。这意味着，一个家庭户只能拥有一处宅基地的使用权。虽然您提到有两处宅基地，但这两处宅基地应该是分别对应两个不同的家庭户（即您和您的父亲各自的家庭户）。因此，将两处宅基地都确权到父亲一人名下，违反了“一户一宅”的原则。

最后，关于宅基地面积超标准的问题，如果确实存在超标情况，相关部门会在登记簿和权属证书中进行注明。待以后分户建房或现有房屋拆迁、改建、翻建、政府依法实施规划重新建设时，会按照有关规定作出处理，并按照各地规定的面积标准重新进行确权登记。

综上所述，将两处合法取得的宅基地都确权到父亲一人名下是不被允许的。如果您对宅基地的确权登记有任何疑问或需要进一步的帮助，建议您咨询当地的土地管理部门或相关法律专业人士。