农村土地承包经营权证在兄弟分家时是否有效，需结合具体情况判断，主要取决于分家协议的合法性及是否符合法定程序。以下从不同角度展开分析：

1. 分家协议的合法性
   若兄弟分家时签订的协议是双方真实意思表示，内容不违反法律强制性规定（如未损害集体或其他成员权益），且符合《民法典》中关于家庭财产分割的规定，则分家协议有效。此时，农村土地承包经营权证可随分家协议中约定的土地分配方案进行变更或分割，但需依法办理相关手续。

2. 土地承包经营权的特殊性
   根据《农村土地承包法》，土地承包经营权以“户”为单位取得，家庭成员对承包地享有共同权益。分家时，若仅是家庭内部对土地使用权的划分（如由某一兄弟实际耕种某块地），但未变更承包合同或经营权证，则原权证仍有效，但实际使用人可能因分家协议获得权益。若需彻底分割权证，需经发包方（村集体）同意，并依法申请变更登记。

3. 程序要求
   即使分家协议合法，若未履行法定程序（如未向发包方报备、未申请变更经营权证），则分割结果可能仅对内部有效，对外（如涉及征地补偿、流转等）仍需以原权证为准。因此，建议分家后及时办理权证变更手续，以保障权益。

建议：

• 分家时签订书面协议，明确土地分配方案及各方权利义务；
  
• 持分家协议向村集体报备，并申请变更土地承包经营权证；
  
• 若遇纠纷，可依据分家协议及权证登记情况主张权利。
  

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