针对您提出的“拆迁时协议已经超过了13年诉讼期怎么办”的问题，这确实是一个涉及法律时效性的复杂情况。不过，即便诉讼时效已经过期，您仍然有一些途径可以尝试维护自己的合法权益。以下是我为您详细梳理的解决方案：
一、理解诉讼时效的重要性及后果
首先，需要明确的是，诉讼时效是法律规定的一段时间，在此期间内，您有权提起诉讼以维护自己的权益。一旦超过这个时限，法院原则上将不再受理您的起诉，除非存在特殊情形。因此，了解并遵守诉讼时效对于维权至关重要。
二、探索可能的维权途径
行政诉讼申诉：
- 如果拆迁纠纷涉及行政决定，如政府拆迁决定、补偿安置方案等，您可以向作出生效裁判的人民法院或上一级人民法院提出申诉。
- 申诉时，请务必提交申诉状、原审裁判文书以及支持您申诉理由的证据材料。
信访与反映问题：
- 向相关政府部门进行信访，详细反映拆迁过程中存在的问题和您的诉求。
- 信访虽然不具有强制执行力，但它是一种有效的反映问题和寻求解决途径的方式，有时能推动问题的解决。
和解与调解：
- 尝试与拆迁方进行协商，寻求和解或调解解决纠纷。
- 和解与调解通常更为灵活，易于双方接受，有助于快速、和平地解决问题。
申请行政复议与附带民事诉讼：
- 根据您的具体案情和证据情况，考虑申请行政复议或提起行政诉讼的附带民事诉讼。
- 这些途径需要专业律师根据您的具体情况制定策略，因此建议您咨询专业律师。
依据新证据重新起诉：
- 如果您发现了新的关键证据，且该证据足以影响案件结果，您可以考虑依据新证据重新起诉。
- 但请注意，重新起诉的成功率取决于新证据的充分性和相关性。
三、分析诉讼时效过期的特殊情况
诉讼时效中断：
- 如果在诉讼时效期间内，您曾提起诉讼、向对方提出要求或对方同意履行义务，那么诉讼时效可能会中断。
- 您需要收集书面函件、协商记录等证据来证明中断情形。
诉讼时效中止：
- 在诉讼时效期间的最后六个月内，如果因不可抗力或其他障碍导致您不能行使请求权，那么诉讼时效可能会中止。
- 您需要提供相关病历、诊断证明等证据来支持您的中止主张。
对方未提出诉讼时效抗辩：
- 如果在诉讼过程中，对方未提出诉讼时效抗辩，那么法院不得主动适用诉讼时效规定进行裁判。
- 在这种情况下，您可以强调这一点，争取法院重新审理案件。
四、收集与保留证据
- 无论您选择哪种维权途径，都需要努力寻找并收集能够支持自己诉求的新证据，如拆迁程序违法、补偿标准不合理等相关证据。
- 如果您无法自行收集证据，可以向法院申请调查取证，以查明拆迁行为是否合法合规。
五、寻求专业法律帮助
- 鉴于拆迁纠纷的复杂性和法律时效性的重要性，我强烈建议您咨询专业拆迁律师。
- 律师可以为您制定合理的申诉策略，指导您收集和整理证据，撰写申诉材料，并代表您进行法律诉讼或申诉。
- 如果您经济困难，可以向当地法律援助机构申请法律援助，获得免费的法律服务。
结论：虽然拆迁纠纷诉讼时效过期后维权难度增加，但通过行政诉讼申诉、信访反映问题、和解调解、申请行政复议与附带民事诉讼以及依据新证据重新起诉等途径，您仍有可能维护自己的合法权益。同时，请务必关注诉讼时效的特殊情况，积极收集与保留证据，并寻求专业法律帮助以提高维权成功率。