若发现自家耕地在不知情的情况下被变更为建设用地，您有权采取法律手段维护自身权益，具体可按以下步骤处理：

1. 核实土地性质变更的合法性
   首先需确认土地性质变更是否经过法定程序。根据《土地管理法》第四十四条，建设占用土地涉及农用地转为建设用地的，需办理农用地转用审批手续，由国务院或省级政府批准。若未履行审批程序，变更行为可能涉嫌违法。您可向当地自然资源部门申请政府信息公开，调取土地规划、审批文件等材料，核查变更是否合法。

2. 确认自身权益是否受损
   若土地性质变更合法，需进一步确认您是否已获得合理补偿。根据《土地管理法》第四十八条，征收土地应给予公平、合理的补偿，包括土地补偿费、安置补助费、地上附着物补偿费等。若未收到补偿或补偿标准过低，您有权要求补足差额。若变更行为违法，您可主张恢复土地原状或要求赔偿损失。

3. 通过行政或司法途径维权

   • 行政途径：向当地自然资源部门、农业农村部门或乡镇政府提出书面异议，要求撤销违法变更决定或重新处理补偿事宜。若部门未履行职责，可向上级政府申请行政复议。
     
   • 司法途径：若行政途径未果，可向法院提起行政诉讼，请求确认变更行为违法或撤销相关行政决定。若因变更行为遭受损失，可同时提起民事赔偿诉讼。

4. 保留关键证据
   维权过程中需注意收集证据，包括土地承包合同、土地权属证书、现场照片、政府信息公开文件、沟通记录等。这些证据将有助于证明您的土地权益及变更行为的违法性。

温馨提示：土地性质变更涉及复杂法律程序，建议您在处理过程中保持冷静，避免与相关部门发生直接冲突。若对法律程序不熟悉，可随时向我咨询具体操作细节，我将为您提供专业指导。