在司法亲子鉴定中，若孩子已满十八岁且拒绝做亲子鉴定，法院通常会尊重孩子的意愿，不会强制其进行鉴定，并可能基于现有证据作出判决。以下是对这一问题的详细分析：

一、法院尊重孩子意愿的原则

1. 自主决定权：根据相关法律规定，已满十八周岁的孩子属于完全民事行为能力人，有权自主决定是否进行亲子鉴定。法院在处理此类案件时，会充分尊重孩子的个人意愿和选择。

2. 保护隐私权：亲子鉴定涉及个人隐私，尤其是对于已成年的孩子来说，其隐私权应得到充分保护。法院不会因一方当事人的请求而强制孩子进行鉴定，以避免对其造成不必要的心理压力和隐私侵犯。

二、法院可能基于现有证据作出判决

1. 证据规则：在民事诉讼中，证据是法院认定事实的基础。若一方当事人提出亲子鉴定的申请，但孩子拒绝配合，法院将不会强制鉴定。此时，法院会依据其他现有证据，如出生证明、户籍登记、亲子关系证明等，来综合判断亲子关系是否存在。

2. 举证责任：在亲子关系争议中，通常由主张存在亲子关系的一方承担举证责任。若该方无法提供充分证据证明亲子关系，且孩子拒绝进行鉴定，法院可能会认定其举证不足，从而驳回其诉讼请求。

三、特殊情况下的处理

1. 涉及公共利益或他人合法权益：在极少数情况下，如亲子关系的认定涉及公共利益或他人合法权益（如继承权、抚养权等），且孩子拒绝鉴定可能导致无法查明事实真相时，法院可能会根据具体情况权衡利弊，考虑是否采取必要措施。但这种情况极为罕见，且需严格遵循法律程序和原则。

2. 孩子无正当理由拒绝：若孩子无正当理由拒绝进行亲子鉴定，且其拒绝行为导致无法查明事实真相、影响案件公正审理的，法院可能会对其拒绝行为进行负面评价，并在判决中予以考虑。但即便如此，法院也不会直接强制孩子进行鉴定。

四、法律建议

1. 协商沟通：在亲子关系争议中，建议双方当事人首先通过协商沟通的方式解决问题。可以尝试通过家庭会议、调解等方式，寻求孩子的理解和配合。

2. 收集其他证据：若孩子拒绝进行亲子鉴定，主张存在亲子关系的一方应积极收集其他证据来支持自己的主张。这些证据可以包括但不限于出生证明、户籍登记、亲子关系证明、照片、视频等。

3. 寻求法律帮助：若双方无法协商解决争议，且主张存在亲子关系的一方认为自己的权益受到侵害，可以寻求专业律师的帮助。律师将根据具体情况提供法律咨询和诉讼代理服务，帮助当事人维护自己的合法权益。

在处理此类案件时，法院会充分考虑孩子的意愿和隐私权保护原则，并依据现有证据作出公正判决。若您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。