您好，关于您提出的“在摩托车停车区停车等红灯是否违法以及如何处理”的问题，我可以为您详细解答。
首先，摩托车停车区，也被称为摩托车等候区，是专门为摩托车设置的等待红灯的区域。这个区域通常位于机动车道与非机动车道之间的白色实线区域内，是摩托车在红灯时合法停车等待的地方。
关于是否违法：
在规定区域等候：如果摩托车在红灯时停在了指定的摩托车等候区内，并且没有越线行驶或占用其他车道，那么这种行为是完全合法的，不会受到任何处罚。
不在规定区域等候：如果摩托车未在指定的摩托车等候区内停车等待，而是停在了其他位置，如机动车道内，那么这就属于“不按规定车道行驶”的违法行为。根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，此类行为可能会面临罚款和扣分的处罚。具体罚款金额和扣分数目因地区而异，但一般来说，罚款金额可能在50元至200元之间，扣分数目可能为1分至3分。
越线停车：另外，如果摩托车在等候区内越过了停止线停车，这也属于违法行为，同样可能面临罚款和扣分的处罚，具体标准与“不按规定车道行驶”相似。
关于如何处理：
接受处罚：如果您因为不在规定区域等候或越线停车等违法行为被交警查处，那么您需要接受相应的罚款和扣分处罚。请按照交警的指示，及时缴纳罚款并处理扣分事宜。
遵守交通规则：为了避免类似违法行为的再次发生，建议您在驾驶摩托车时严格遵守交通规则，特别是在红灯时一定要停在指定的摩托车等候区内，不要越线行驶或占用其他车道。
了解当地规定：由于不同地区的交通法规和处罚标准可能存在差异，因此建议您在驾驶前了解当地的交通法规和处罚标准，以便更好地遵守交通规则并避免不必要的麻烦。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。