您好，关于您提出的“不在摩托车停放区等红绿灯怎么处罚”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，摩托车等候区是专为摩托车设置的等待红灯的区域，它通常位于机动车道与非机动车道之间的白色实线区域内。当绿灯亮起时，摩托车应优先通过路口；红灯亮起时，则应在等候区内停车等待。这是摩托车在红绿灯路口的基本行驶规则。

如果您未在指定的摩托车等候区内停车等待，而是停在了其他位置，比如机动车道内，那么这种行为就属于“不按规定车道行驶”的违法行为。根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，此类行为可能会面临罚款和扣分的处罚。具体来说，罚款金额和扣分数目会因地区而异，但一般来说，罚款金额可能在50元至200元之间，扣分数目可能为1分至3分。

此外，如果摩托车在等候区内越过了停止线停车，这也同样属于违法行为，同样可能面临罚款和扣分的处罚，具体标准与“不按规定车道行驶”相似。

除了上述两种情况外，如果摩托车在等待红灯时还存在其他违法行为，如闯红灯、逆行、超速等，那么也将根据相关法律法规进行相应的处罚。例如，闯红灯可能面临罚款200元并记6分的处罚；逆行和超速则根据具体情况进行罚款和扣分。

因此，我建议您在驾驶摩托车时，一定要严格遵守交通规则，按照指定的区域和车道行驶，以确保自己和他人的安全。如果您还有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时告诉我。