结论：在京东物流自离通常也需要写离职申请，不过具体是否必须写可能因公司内部规定、劳动合同约定以及实际情况有所不同。以下从不同角度进行分析：
- 从公司内部管理规定角度：
京东物流作为大型企业，一般会有完善的员工离职管理制度。即便员工是自离（即未按照正常流程提前申请并办理交接等手续而自行离职），从公司规范管理、人员信息记录以及工作交接等角度出发，公司可能仍会要求员工填写离职申请。填写离职申请有助于公司了解员工离职原因、统计离职数据、安排后续工作交接等，以保障公司运营的连续性和稳定性。例如，公司可以通过离职申请中的离职原因反馈，分析是否存在普遍性的管理问题或员工需求未满足的情况，进而进行改进。
- 从劳动合同约定角度：
劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。如果劳动合同中明确规定了员工离职需要按照特定流程提交离职申请，那么无论是正常离职还是自离，员工都应当遵守该约定。若员工不按照合同约定履行离职手续，可能构成违约行为，公司有权依据合同约定追究员工的相应责任，比如要求员工赔偿因未按规定离职给公司造成的损失等。不过，如果劳动合同中没有明确相关约定，公司要求自离员工写离职申请更多是基于内部管理需要，而非法律强制要求。
- 从实际情况角度：
在实际操作中，有些员工自离可能是因为突发紧急情况等特殊原因，无法提前按照正常流程提交离职申请。在这种情况下，公司可能会根据实际情况进行灵活处理。例如，对于一些关键岗位员工，公司可能会先与员工沟通了解情况，要求员工在条件允许的情况下尽快补交离职申请；而对于一些普通岗位员工，如果自离未对公司造成明显影响，公司可能不会过于强求员工补写离职申请。但如果员工自离给公司造成了较大损失，如重要工作未交接导致项目延误、公司财物未归还等，公司不仅可能要求员工补写离职申请，还可能通过法律途径追究员工的赔偿责任。