结论：体制内停薪留职期间一般不可以自己开公司当法人，但具体需结合单位性质、停薪留职协议约定及地方政策综合判断。以下从不同角度展开分析：

1. 从公务员/事业单位人员管理规定角度

根据《公务员法》第五十九条及《事业单位工作人员处分暂行规定》第十八条，公务员及事业单位工作人员不得从事或者参与营利性活动，包括在企业或其他营利性组织中兼任职务（含法人代表）。即使处于停薪留职状态，其编制和身份仍保留，原则上仍需遵守上述规定。若违反，可能面临警告、记过甚至开除处分。

例外情形：若单位明确允许停薪留职期间从事经营活动（需书面协议），或地方政策有特殊规定（如部分地区允许科研人员兼职创业），则可能例外。但此类情形极少，需以单位书面文件或地方政策为准。

2. 从国有企业/集体企业员工管理角度

国有企业员工停薪留职期间，若单位与员工签订的协议中未明确禁止从事经营活动，且员工未利用单位资源或职务便利，理论上可以开公司当法人。但需注意：

• 竞业限制：若原单位涉及商业秘密或核心技术，可能通过内部规定或劳动合同限制员工在同类行业创业；
• 社保关系：停薪留职期间社保可能仍由原单位缴纳，若开公司需以法人身份缴纳社保，可能产生冲突，需提前与单位协商。

3. 从法律风险角度

即使单位允许或地方政策宽松，仍需警惕以下风险：

• 利益冲突：若原单位与新公司存在业务竞争或关联交易，可能涉嫌违反《公司法》中的“竞业禁止”或“关联交易”规定；
• 税务合规：作为法人需确保新公司依法纳税，若原单位发现员工通过新公司转移利润或逃避税收，可能追究责任；
• 协议违约：停薪留职协议中若明确禁止经商，擅自开公司可能构成违约，需承担赔偿责任。

4. 实务建议

1. 核查单位规定：优先查阅停薪留职协议、单位规章制度或地方政策，确认是否允许经商；
2. 书面申请备案：若单位无明确禁止，建议向单位提交书面申请，说明经营范围、是否利用单位资源等，留存书面同意文件；
3. 避免利益冲突：确保新公司与原单位无业务竞争，不使用原单位商标、技术或客户资源；
4. 咨询专业意见：涉及复杂情形（如国企高管、涉及核心技术等），建议提前咨询律师或劳动部门，规避法律风险。

总结：体制内停薪留职期间开公司当法人风险较高，需以单位明确允许为前提，并严格遵守竞业限制、税务合规等要求。如有具体案例或协议条款，可进一步向我咨询，我会结合细节为您分析。