两种特殊工种的工龄在申请退休时，在一定条件下是可以合并计算的。以下是对此问题的详细解析：
一、政策依据与合并计算的条件
政策依据明确：根据原劳动部《关于贯彻执行〈国务院关于工人退休、退职的暂行办法〉的若干具体问题的处理意见》及相关法律法规和政策规定，从事井下、高空、高温、特别繁重体力劳动或其他有害身体健康工作的工人，其特殊工种的工作年限可以累计计算，无论这些工作是在同一企业还是不同企业中完成。
工种属于规定范围：要合并计算的两种特殊工种必须均列入国家认可的特殊工种名录。不同行业有特殊工种目录，如煤炭、冶金等，只有被列入这些目录的工种，其工作年限才可用于特殊工种退休的认定。例如，如果一位工人既从事过井下作业，又从事过高温作业，且这两种工种都在国家认可的特殊工种名录中，那么他的这两种工种的工作年限就有可能合并计算。
达到规定年限：累计的特殊工种工作年限需满足国家规定。具体而言，从事高空和特别繁重体力劳动工作需累计满10年；井下、高温工作需累计满9年；其他有害身体健康工作需累计满8年。这是合并计算工龄并申请特殊工种退休的基本前提。
原始资料证明：必须有完整、有效的原始档案材料（如工资表、考勤表、工作证、任命书等）来证明从事特殊工种的工作经历和工作年限。这些材料应清晰显示特殊工种的起始时间、工作内容等信息，以便社保部门进行审核。
二、申请流程与注意事项
档案审核：当职工达到男年满55周岁、女年满45周岁的年龄要求，并认为自己符合特殊工种退休条件时，应向所在单位或档案托管机构提出申请。单位或机构会对职工的档案进行初步审核，检查特殊工种工作经历的记载是否完整、清晰。
提交申请：审核通过后，单位或职工本人需向当地社保部门正式提交特殊工种退休申请，并提供相关材料，包括但不限于身份证、档案、特殊工种岗位登记表等。这些材料是社保部门审批的重要依据。
社保部门审批：社保部门将严格审批提交的申请和材料，核实特殊工种工作年限是否符合合并计算的条件以及是否达到规定的退休年限要求。审批通过后，职工可按特殊工种退休政策办理退休手续，享受相应的退休待遇。
地区与行业差异：值得注意的是，工龄合并的具体操作可能因地区和行业而有所不同。因此，在申请过程中，建议咨询当地的社保部门或向我这样的专业劳动法律师咨询，以获取更准确的信息和指导。
三、可能遇到的法律后果与建议
如果工龄合并申请被拒绝：可能是因为提供的原始档案材料不完整或不符合要求，或者特殊工种的工作年限未达到规定标准。此时，职工可以补充完善相关材料或了解具体原因后再次申请。
如果对审批结果有异议：职工可以向社保部门提出申诉或申请行政复议，甚至可以通过法律途径维护自己的合法权益。
综上所述，两种特殊工种的工龄在申请退休时是可以合并计算的，但需满足一定的条件和遵循特定的申请流程。在实际操作中，应充分考虑地区和行业差异，并咨询相关部门或专业律师以确保申请的准确性和有效性。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。