医师注册的主要执业机构和医师之间确实可以不是劳动关系，而是劳务派遣关系。以下从不同角度对此问题进行详细分析：
一、法律关系的本质
劳动关系与劳务派遣关系的区别：
- 劳动关系：是指用人单位与劳动者之间，依法所确立的劳动过程中的权利义务关系。在这种关系中，劳动者直接为用人单位提供劳动，并接受用人单位的管理和指挥。
- 劳务派遣关系：则是一种特殊的用工形式，其中劳务派遣单位与劳动者签订劳动合同，建立劳动关系，并将劳动者派遣至实际用工单位工作。在这种关系中，劳动者与实际用工单位之间并不直接建立劳动关系，而是通过劳务派遣单位形成间接的用工关系。
医师注册与执业机构的关系：
- 医师注册的主要执业机构是医师依法进行执业注册的医疗机构，它代表了医师的执业资格和执业地点。
- 医师与主要执业机构之间的关系，并不必然是劳动关系。它们之间可以建立多种形式的用工关系，包括但不限于劳动关系、劳务关系、劳务派遣关系等。
二、劳务派遣关系的适用性
劳务派遣的合法性：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》等相关法律法规，劳务派遣作为一种合法的用工形式，被广泛应用于各个领域，包括医疗行业。
- 在医疗行业中，劳务派遣可以用于解决医疗机构临时性、辅助性或者替代性的工作岗位需求，如医师、护士等医疗人员的短期或项目性用工。
医师与主要执业机构建立劳务派遣关系的条件：
- 医师需要与劳务派遣单位签订劳动合同，建立劳动关系。
- 劳务派遣单位需要与医师注册的主要执业机构签订劳务派遣协议，明确双方的权利和义务。
- 医师需要按照劳务派遣协议的约定，在主要执业机构提供劳动服务。
三、实际案例与操作建议
实际案例：
- 在实践中，确实存在医师与主要执业机构之间通过劳务派遣形式建立用工关系的情况。例如，某些医疗机构可能因为临时性或项目性的需求，而选择通过劳务派遣单位雇佣医师。
操作建议：
- 对于医师而言，在选择与主要执业机构建立劳务派遣关系时，应仔细阅读劳务派遣协议和劳动合同，确保自己的权益得到充分保障。
- 对于医疗机构而言，在选择使用劳务派遣形式雇佣医师时，应遵守相关法律法规，确保劳务派遣的合法性和合规性。
- 无论是医师还是医疗机构，在建立劳务派遣关系时，都应咨询专业律师的意见，以确保合同的合法性和有效性。
四、可能存在的风险与防范
风险：
- 劳务派遣关系可能带来一些潜在的风险，如劳务派遣单位与医疗机构之间的责任划分不清、医师的权益保障不足等。
防范：
- 为防范这些风险，医师和医疗机构应在签订劳务派遣协议和劳动合同时，明确双方的权利和义务，以及责任划分和争议解决方式。
- 同时，双方应加强对劳务派遣单位的监督和管理，确保其依法履行义务，保障医师的合法权益。
总结来说，医师注册的主要执业机构和医师之间可以建立劳务派遣关系。然而，在建立这种关系时，双方应遵守相关法律法规，明确各自的权利和义务，并咨询专业律师的意见以确保合同的合法性和有效性。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。