在建设工程合同中，若公章是假的，法院的认定会综合考虑多种因素，并非一概而论。以下是从不同角度对法院可能认定情况的分析：
合同无效的情形：
- 恶意串通损害他人利益：若合同双方均明知使用的是假公章，且目的为损害国家、集体或第三人利益，根据《民法典》第一百五十四条，该合同将被认定为无效。例如，在建设工程领域，若甲乙两公司合谋使用假公章签订虚假合同以套取工程款，损害了发包方或银行的利益，合同因此无效。
- 违反法律法规强制性规定：若合同内容违反法律、行政法规的强制性规定，如未经批准擅自建设、违反建筑安全标准等，无论公章真伪，合同均自始无效。
合同可撤销的情形：
- 欺诈手段签订合同：当一方当事人使用假公章欺骗另一方，导致对方在违背真实意思的情况下签订合同，受欺诈方有权依据《民法典》第一百四十八条请求法院或仲裁机构撤销合同。例如，在建设工程合同中，若承包方使用假公章与发包方签订合同，发包方在不知情的情况下签订，发包方可在知道或应当知道撤销事由之日起一年内行使撤销权。
合同有效的情形：
- 构成表见代理：根据《民法典》第一百七十二条，若使用假公章的一方在签订合同时存在使相对人有理由相信其有代理权的表象（如持有单位空白合同书、工作证、项目负责人身份等），且相对人主观上善意且无过失，则该合同对被代理人（即实际公司）具有约束力，应认定为有效。例如，在建设工程中，若项目经理长期代表公司签订合同，后使用假公章签约但发包方有合理理由相信其仍有代理权，此时合同有效。
- 公司追认：即使使用假公章，若公司事后通过实际履行合同义务（如支付工程款、提供材料等）或出具书面追认文件等方式对该合同进行追认，则合同被视为有效。
涉及刑事犯罪的处理：
- 伪造公司印章罪：若使用假公章的行为涉嫌伪造公司印章罪，根据《刑法》第二百八十条的规定，可处三年以下有期徒刑、拘役、管制或剥夺政治权利，并处罚金。在建设工程领域，若承包方或分包方私刻发包方公章签订合同，可能构成此罪。
- 合同诈骗罪：若以非法占有为目的，在签订、履行合同过程中采取欺骗手段骗取对方当事人财物，数额较大的，涉嫌合同诈骗罪。根据《刑法》第二百二十四条的规定，将受到相应的刑事处罚。
法律建议：
- 在签订建设工程合同时，各方应严格审查对方身份信息和公章真伪，确保交易的合法性与安全性。
- 对于可能存在的表见代理情况，应更加谨慎地评估对方的代理权限和履约能力，必要时可要求对方提供授权委托书或公司追认文件。
- 若发现对方使用假公章签订合同，应及时向相关部门举报并配合调查处理，以维护自身合法权益和社会经济秩序。
总结：在建设工程合同中，若公章是假的，法院的认定会综合考虑公章的真伪、双方当事人的意思表示、交易习惯、法律法规及是否存在表见代理或公司追认等因素。因此，在处理此类纠纷时，应遵循法律规定，结合案件事实，做出准确有效的法律判断。如有具体法律问题，可直接向我咨询。